南方水稻黑条矮缩病苗期抗性基因解析：关联、定位与候选基因洞察.docxVIP

南方水稻黑条矮缩病苗期抗性基因解析：关联、定位与候选基因洞察

一、引言

1.1研究背景与意义

水稻作为全球最重要的粮食作物之一，为世界近一半人口提供主食，其安全生产对于保障粮食安全至关重要。然而，水稻生产面临着诸多生物胁迫，其中南方水稻黑条矮缩病（SouthernRiceBlack-streakedDwarfDisease）是一种极具破坏力的病毒性病害，给水稻产业带来了严重威胁。

自2001年在广东粤西首次被发现以来，南方水稻黑条矮缩病的发生面积不断扩大，危害逐年加重，已成为我国南方稻区及南亚、东南亚稻区最主要、危害最严重的水稻病毒病害之一。该病害通过远距离迁飞性害虫白背飞虱（Sogatellafurcifera）以持久增殖型方式传播，白背飞虱若虫、成虫均可传毒且终生带毒，初侵染源为迁入带毒白背飞虱，初侵染源稻株上扩繁的下代白背飞虱高效传毒是病害成灾的关键因子。一旦水稻感染南方水稻黑条矮缩病毒（SouthernRiceBlack-streakedDwarfVirus,SRBSDV），会出现一系列典型症状，如植株矮缩，叶色浓绿，叶尖卷曲，上部叶近基部叶面形成凹凸不平的皱褶；拔节期的病株茎节部有气生须根及高节位分枝；茎秆表面生有大小约1-2mm蜡点状纵向排列的乳白色瘤状突起，瘤突后期呈褐黑色。这些症状严重影响水稻的生长发育，导致结实率大幅降低，甚至不抽穗，从而造成严重的产量损失。在一些严重发生的地区，水稻减产可达50%以上，部分田块甚至绝收，给农民带来了巨大的经济损失。

选育和种植抗病品种是防治南方水稻黑条矮缩病最为经济、有效和环保的措施。而深入研究水稻苗期抗性基因，是培育抗病品种的关键前提。在水稻的生长周期中，苗期是其生长发育的关键阶段，也是对病害最为敏感的时期之一。苗期感染南方水稻黑条矮缩病，会对水稻的后续生长产生深远的负面影响，导致植株矮小、分蘖减少、穗粒数降低等，最终严重影响产量。通过挖掘和利用苗期抗性基因，可以从遗传层面增强水稻对病害的抵御能力，为培育具有持久、广谱抗性的水稻新品种提供坚实的基因资源和理论基础。这不仅有助于减少化学农药的使用，降低环境污染，还能稳定水稻产量，保障粮食供应的安全和稳定，对于维护农业生态平衡和可持续发展具有重要的现实意义。因此，开展南方水稻黑条矮缩病苗期抗性基因的研究迫在眉睫，具有重要的科学价值和实践意义。

1.2国内外研究现状

国内外学者针对南方水稻黑条矮缩病抗性基因开展了一系列研究并取得了一定成果。在抗性资源筛选方面，通过对大量水稻品种的接种鉴定，发现不同水稻品种对南方水稻黑条矮缩病的抗性存在显著差异。部分野生稻资源及少数栽培稻品种表现出一定的抗性，这些抗性材料为后续抗性基因的挖掘提供了基础材料。

在抗性基因定位与克隆上，利用分子标记技术和遗传群体构建，一些与抗性相关的数量性状位点（QTL）被定位。例如，通过构建重组自交系群体（RILs）和染色体片段代换系群体（CSSLs），在水稻的多条染色体上检测到与南方水稻黑条矮缩病抗性相关的QTL。然而，目前成功克隆并进行功能验证的抗性基因相对较少。

在抗病机制研究方面，发现植物的RNA沉默通路在抵御南方水稻黑条矮缩病毒侵染过程中发挥重要作用。RNA沉默通路中的关键蛋白如Dicer-like（DCL）、Argonaute（AGO）以及RNA-dependentRNApolymerase（RDR）等参与识别和降解病毒RNA，从而抑制病毒的复制与传播。此外，植物激素信号通路如茉莉酸（JA）、水杨酸（SA）等也与水稻对南方水稻黑条矮缩病的抗性相关，它们通过调控植物的防御反应基因表达来增强抗性。

尽管取得了上述成果，但现有研究仍存在不足。一方面，已定位的QTL区间较大，包含众多候选基因，难以精确确定关键抗性基因，限制了抗性基因的克隆与应用。另一方面，对于南方水稻黑条矮缩病抗性的分子机制研究还不够深入全面，许多参与抗病过程的基因及信号通路尚未被揭示，这阻碍了通过基因工程手段培育抗病品种的进程。此外，目前的研究主要集中在少数水稻品种上，对于不同生态型水稻品种的抗性基因研究较少，缺乏对水稻抗性遗传多样性的全面了解。

1.3研究目标与内容

本研究旨在通过关联分析、精细定位和候选基因分析，深入挖掘南方水稻黑条矮缩病苗期抗性关键基因，为水稻抗病育种提供理论基础和基因资源。具体研究内容如下：

南方水稻黑条矮缩病抗性材料的筛选与鉴定：收集不同来源的水稻种质资源，包括野生稻、地方品种和现代栽培品种等。通过人工接种南方水稻黑条矮缩病毒，在苗期对这些种质资源进行抗性鉴定，筛选出具有稳定抗性的材料，为后续研究提供材料基础。

基于全基因组关联分析（GWAS）的抗性基因初步定位：利用高通量测序技术对筛选出的水稻种质资源