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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
新一代测序技术(NGS)的核心特点是?
A.单分子实时测序,无需PCR扩增
B.高通量、短读长、大规模平行测序
C.仅能检测点突变,无法识别结构变异
D.成本高、耗时久,仅适用于科研场景
答案:B
解析:NGS的核心特点是高通量(同时检测数百万DNA片段)、短读长(通常50-300bp)和大规模平行测序(区别于Sanger的单片段测序)。A为三代测序(如PacBio)特点;C错误,NGS可通过生物信息学方法检测结构变异;D错误,NGS已广泛应用于临床检测(如肿瘤基因panel)。
ClinVar数据库的主要功能是?
A.存储全基因组测序原始数据(FASTQ文件)
B.收集变异与疾病关联的致病性证据
C.提供基因功能注释的GO术语数据库
D.记录药物与基因相互作用的临床实验数据
答案:B
解析:ClinVar是NCBI维护的变异致病性数据库,整合了实验室、文献和公共数据库的致病性分类(如“致病”“可能致病”)。A为SRA数据库功能;C为GO数据库功能;D为DrugBank功能。
ACMG变异分类标准中将变异分为几类?
A.3类(良性、意义未明、致病)
B.4类(良性、可能良性、可能致病、致病)
C.5类(良性、可能良性、意义未明、可能致病、致病)
D.6类(新增“药物反应相关”)
答案:C
解析:ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)2015年指南明确将变异分为5类:良性(Benign)、可能良性(Likelybenign)、意义未明(VUS)、可能致病(Likelypathogenic)、致病(Pathogenic)。其他选项不符合标准分类。
以下哪种变异最可能被判定为“同义突变”?
A.编码区C→T替换,导致氨基酸由精氨酸(Arg)变为终止密码子
B.内含子-外显子边界的剪接位点突变(±2位置)
C.编码区G→A替换,密码子由GCC(丙氨酸)变为GCA(丙氨酸)
D.3号外显子缺失3个碱基,导致移码突变
答案:C
解析:同义突变指编码区核苷酸替换但不改变氨基酸的变异(如C选项中GCC和GCA均编码丙氨酸)。A为无义突变;B为剪接突变;D为移码突变(缺失非3倍数碱基)。
肿瘤基因检测报告中“TMB(肿瘤突变负荷)”的单位通常是?
A.突变数/百万碱基(Mut/Mb)
B.突变数/基因(Mut/Gene)
C.突变数/外显子(Mut/Exon)
D.突变数/样本(Mut/Sample)
答案:A
解析:TMB定义为每百万碱基中体细胞非同义突变的数量(Mut/Mb),是免疫治疗(如PD-1抑制剂)的重要生物标志物。其他单位不符合行业共识(如ESMO指南)。
gnomAD数据库的主要用途是?
A.提供肿瘤驱动基因列表
B.统计人群中变异的频率
C.存储单基因病的致病突变
D.预测蛋白质三维结构
答案:B
解析:gnomAD(基因组聚集数据库)整合了超过14万人的基因组数据,主要用于统计变异在正常人群中的频率(如MAF,次要等位基因频率),辅助判断变异是否为“罕见致病”。A为COSMIC数据库功能;C为OMIM功能;D为AlphaFold功能。
以下哪项不属于外显子测序(WES)的局限性?
A.无法检测非编码区调控元件变异
B.对拷贝数变异(CNV)的检测灵敏度低于WGS
C.覆盖区域受捕获探针设计限制
D.测序读长显著短于三代测序技术
答案:D
解析:WES与NGS平台(如Illumina)共用测序技术,读长与WGS一致(通常150-300bp),其局限性主要是覆盖区域限制(A、C)和CNV检测能力(B)。三代测序(如PacBio)的长读长是其优势,与WES无关。
遗传病基因解读中,“家系共分离分析”的核心目的是?
A.验证变异是否为新发突变(Denovo)
B.确认变异与疾病表型的遗传模式是否一致
C.排除测序过程中产生的技术误差
D.预测变异对蛋白质功能的影响
答案:B
解析:共分离分析通过检测家系成员中变异与疾病表型的共传递情况(如常染色体显性遗传病中患者应携带变异,未患病亲属不应携带),验证变异与疾病的因果关系。A是新发突变的判断方法;C通过重复测序或Sanger验证;D通过功能预测工具(如SIFT、PolyPhen-2)。
以下哪种变异注释工具主要用于预测剪接位点改变?
A.SIFT
B.PolyPhen-2
C.dbNSFP
D.SpliceAI
答案:D
解析:SpliceAI是专门预测剪接位点变异(如内含子-外显子边界突变)对剪接效率影响的工具。A(SIFT)和B(PolyPhen-2)预测错义突变对蛋白质功能的影响;C(dbNSFP)整合多种功能预测结果的数据库。
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