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第五章DNA序列测定技术;DNA测序:是对DNA?分子的一级结构的分析。其基本原理是DNA?的复制反应体系中需要存在DNA?聚合酶、DNA?模板、寡核苷酸引物和dNTP,引物和模板退火形成双链后,DNA?聚合酶在引物的引导下在模板链上沿3’→5’的方向移动,dNTP?按照碱基配对原则,逐个连接在引物的3’-OH?末端。;;双脱氧末端终止法测序原理示意图;2.Maxam-Gilbert化学降解法测序原理;;硫酸二甲酯[dimethylsulphate,DMS,(CH3O)2SO2]是一种碱性化学试剂,可以使DNA链上的腺嘌呤A的N2和鸟嘌呤G的N7甲基化,但是鸟嘌呤G的N7甲基化速度比腺嘌呤A的N2甲基化速度要快4-10倍,并且在中性pH环境中,DMS主要作用于鸟嘌呤G,使之甲基化,导致糖苷键断裂。
;哌啶甲酸可以使DNA链上的嘌呤在酸的作用下发生糖苷水解,导致DNA链在脱嘌呤位点(G和A)发生断裂。
肼,又称联氨NH2.NH2,在碱性环境中作用于胞嘧啶C和胸腺嘧啶T的C4和C6位置,导致糖苷键断裂。如果加入高浓度的盐(1.2MNaOH),肼则主要作用于胞嘧啶C,使之断裂。;二、二代测序技术——自动化测序基本原理
;步骤1:毛细管灌胶;步骤2:样品盘移动;步骤3:电进样及电泳;步骤4:荧光激发及检测;测序结果;
原理;DNA的PCR与DNA的测序反应的比较;三、DNA测序的多种应用;;;
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