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近交、亲缘系数的计算
近交、亲缘系数计算近交系数:表示纯合的相同等位基因来自共同祖先的机率。也表示杂合基因比近交前所占比例减少的程度;或形成个体的两个配子间因近交而造成的相关系数。根据通径系数原理,个体x的近交系数即是形成x个体的两个配子间的相关系数,用Fx表示。一、近交系数的概念
近交、亲缘系数计算二、近交系数的计算其中:n1为由父亲到共同祖先的代数;n2为由母亲到共同祖先的代数;FA为共同祖先本身的近交系数;Σ表示所有共同祖先计算值的总和。如共同祖先不是近交所生个体,公式简化为:
XSD2131种畜x的系谱如下,试计算近交、亲缘系数计算二、近交系数的计算(1)系谱通径图的绘制一般用“x”代表某个体,用“S”和“D”分别代表它的父亲和母亲,其他个体标以各自的畜号或名字;每个个体在图中只占一个位置,不涉及近交的个体不必绘出;箭头由共同祖先引出,通过各祖代指向其父、母,归结于个体x,即成通径图。
近交、亲缘系数计算二、近交系数的计算(1)系谱通径图的绘制一般用“x”代表某个体,用“S”和“D”分别代表它的父亲和母亲,其他个体标以各自的畜号或名字;每个个体在图中只占一个位置,不涉及近交的个体不必绘出;箭头由共同祖先引出,通过各祖代指向其父、母,归结于个体x,即成通径图。XDS1(2)计算方法从系谱通径图来看,X的共同祖先是1,且1个体为非近交个体,它的近交系数。从父亲S通过1到母亲D的通路有一条。
近交、亲缘系数计算三、群体近交程度的计算A、畜群小时,分别求出各个体值,再平均。B、畜群很大时,随机抽样计算平均值。C、对于封闭群体:ΔF为畜群平均近交系数的每代增量;NS为每代参加配种的公畜数;ND为每代参加配种的母畜数。当群体每代近交系数增量不变时,有:Ft=1-(1-ΔF)t;t为世代数;Ft为第t世代的近交系数。
近交、亲缘系数计算四、亲缘系数的概念亲缘系数表示双亲间的亲缘程度,是说明双亲间的遗传相关程度;而近交系数表明个体本身是由什么程度的近交产生的。亲缘关系分为旁系亲属和直系亲属两类。
近交、亲缘系数计算五、亲缘系数的计算旁系亲属是指同一代上的两个个体之间的关系。直系亲属是指某个个体和祖先的关系。RSD表示个体S和D间的亲缘系数;N为S和D分别到共同祖先的代数之和:N=n1+n2FS为个体S的近交系数;FD为个体D的近交系数;FA为共同祖先的近交系数。RxA为个体到其祖先A个体间的亲缘系数;N为由个体X到其祖先A的世代数;FX为个体的近交系数;FA为A个体的近交系数。
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