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西番莲叶绿体基因组密码子偏好性分析
摘要:将西番莲的叶绿体基因组中挑选出的51条蛋白质编码基因序列分析其偏好
性,此研究利用Condow、SPSS软件来计算并获得了各个基因密码子3个位置的GC含量
和3个位置的ENC值以及所有基因序列的RSCU值。结果表明:西番莲叶绿体基因的有效
密码子数(ENC)在38.88~61.00之间,其密码子的使用偏好性比较弱。经过分析,
RSCU1共有30个密码子,其中有16个密码子是以U结束,13个密码子以A结束,1个
密码子以G结束,表明第3位密码子碱基偏好A、U结束。在中性绘图
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