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陆稻显性半矮杆基因qDH1的精准定位与育种潜力深度剖析

一、引言

1.1研究背景

陆稻，作为水稻的一种特殊生态型，在农业生产中占据着不可或缺的地位。它具有耐旱、耐瘠等优良特性，能够在干旱缺水的旱地、坡地及部分坡度较缓的山地种植，仅靠自然降雨或少量灌溉即可正常收获。全球旱稻种植面积约有1900万公顷，占全球总体栽培稻面积的12.7%，在南美洲、非洲和亚洲均有集中分布。在我国，陆稻种植历史悠久，早在北魏时期的《齐民要术》中就有关于陆稻栽培技术的记载。陆稻对于保障粮食安全、充分利用边际土地资源以及应对水资源短缺挑战具有重要意义。

株高是影响陆稻产量和抗倒伏能力的关键农艺性状之一。过高的植株在生长后期容易倒伏，导致产量降低和品质下降；而矮秆植株则具有耐密植、抗倒伏、适合机械化收割等优点。20世纪中期，“绿色革命”通过利用矮化基因改良水稻、小麦等作物株型，培育出高产品种，显著提高了粮食产量。在水稻育种中，矮秆基因的利用取得了巨大成功，如国际水稻研究所培育的IR8，集植株矮化、茎秆硬化、抗病虫性强等优点于一体，在多个试验地均打破了产量的最高纪录。矮秆性状在陆稻育种中同样具有重要作用，合适的矮秆性状能够提高陆稻的抗倒伏能力，增加种植密度，从而提高单位面积产量，同时也便于田间管理和机械化作业。

目前，虽然在水稻矮秆基因研究方面取得了丰硕成果，如sd1基因是水稻“绿色革命”中最重要的矮秆基因之一，其突变导致赤霉素合成受阻，从而使植株矮化。然而，陆稻矮秆基因的研究相对滞后，尤其是对于一些具有特殊遗传特性的矮秆基因，如陆稻显性半矮杆基因qDH1的研究还较为匮乏。对qDH1基因的深入研究，有助于揭示陆稻矮秆性状的遗传机制，为陆稻矮秆品种的选育提供理论基础和基因资源。

1.2研究目的与意义

本研究旨在通过精细定位陆稻显性半矮杆基因qDH1，明确其在染色体上的具体位置和遗传效应，并对其育种价值进行全面评价。具体目标包括：利用分子标记技术和遗传群体，将qDH1基因定位到染色体的特定区域；通过基因克隆和功能验证，揭示qDH1基因调控陆稻株高的分子机制；评估qDH1基因在陆稻育种中的应用潜力，为培育高产、抗倒伏的陆稻新品种提供理论依据和技术支持。

对陆稻显性半矮杆基因qDH1的研究具有重要的理论和实践意义。在理论方面，有助于深入了解陆稻株高调控的遗传机制，丰富植物矮秆性状的分子生物学理论。通过对qDH1基因的研究，可以揭示陆稻在进化过程中形成的独特株高调控途径，为其他作物的株高遗传研究提供参考。在实践方面，为陆稻矮秆品种的选育提供了重要的基因资源和技术手段。利用qDH1基因，可以通过分子标记辅助选择等技术，快速、准确地将矮秆性状导入到优良陆稻品种中，培育出具有理想株型的新品种，提高陆稻的产量和抗倒伏能力，促进陆稻产业的发展，对于保障粮食安全和农业可持续发展具有重要意义。

1.3国内外研究现状

在陆稻基因研究方面，国内外学者取得了一系列成果。华大生命科学研究院联合华中农业大学利用Stereo-seq时空组学技术，系统性地解析了陆稻根系适应干旱的分子机制，并鉴定出关键调控基因HMGB1，为作物抗旱遗传改良提供了新思路。中国科学院西双版纳热带植物园和云南大学余迪求研究组合作发现UDP-葡萄糖基转移酶基因EDR1在水陆稻间存在自然变异，陆稻中EDR1酶活性明显偏低，最终导致陆稻胚乳发育不良，为解决陆稻胚乳发育不良及陆稻品种改良提供理论基础。然而，目前陆稻基因研究主要集中在抗旱、耐瘠等性状相关基因，对于株高相关基因的研究相对较少。

在矮杆基因定位方面，水稻中已定位和克隆了多个矮杆基因，如sd1、OsUBR7等。sd1基因编码赤霉素合成关键酶，其突变导致赤霉素合成受阻，植株矮化，在水稻“绿色革命”中发挥了重要作用。OsUBR7基因编码一个单泛素化修饰组蛋白H2B的E3泛素连接酶，通过调节细胞周期进程影响株高。在小麦中，也克隆到了矮秆基因Rht8，揭示了其通过调节赤霉素合成相关基因影响株高的机制。但陆稻矮杆基因定位研究起步较晚，进展相对缓慢。目前已报道的陆稻矮杆基因较少，对其遗传特性和分子机制的了解还十分有限。

现有研究在陆稻矮杆基因研究方面存在明显不足。一方面，研究对象主要集中在少数已知矮杆基因在陆稻中的同源性分析和初步定位，对于一些新的、具有独特遗传特性的矮杆基因，如陆稻显性半矮杆基因qDH1的研究几乎空白。另一方面，在矮杆基因的育种应用方面，虽然提出了分子标记辅助选择等方法，但由于对陆稻矮杆基因的遗传机制和育种价值缺乏深入了解，导致这些方法在实际育种中的应用效果不佳。本研究针对陆稻显性半矮杆基因qDH1开展定位和育种价值评价，有望填补这一领域的