放射组学:从基因组到解剖学多尺度关联研究.pdfVIP

放射组学:从基因组到解剖学多尺度关联研究.pdf

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()组学:从组到解剖学,然

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RJGillies,(Robert.Gillies@moffitt.org)影像和代谢系主

任HLeeMoffitt和;佛罗里达州坦帕33602

目标受众:–临床科医生和影像信息学家目标:–

1.了解生理组和功能成像之间的关系2.描述和区分不可知论、语义

和栖息地特征。

背景

虽然人们普遍认为“是一种遗传性疾病”,

但远比这复杂得多。是复杂的、不断发展的、

多尺度的生态系统,其特点是深刻的空间和时间异质

性。了解需要详细了解复杂的动力系统。相互作用

是非线性的,因为一个变量的微小变化可能会对另一个

变量产生很大的变化。成像是这项研究的,因为它

可以非破坏性地纵向表征表型和环境在进化过程中

的空间和行为变化。改变的“组”的影响通过所表

达的的补充(“转录组”)来体现。转换自

到转录本是非线性过程,可能受到遗传和表观遗传以及与周围微环境相互作用的影响。同样,从

到转录本是非线性过程,可能受到遗传和表观遗传以及与周围微环境相互作用的影响。同样,从

转录组到“蛋白质组”、“代谢组”和“生理组”的转换也受到与微环境相互作用的强烈影响。表达、

代谢和生理学的产物进一步使其变得复杂,进而从细胞输出到微环境,为细胞间通讯管道。微环境包含

细胞、蛋白质和小分子,所有这些都会影响的生长和对治疗的反应。在人类中,微环境是本身

不可分割的一部分,而在动物模型中,微环境通常与分离。

这些不同层次的组织可以通过非侵入性分子、功能或解剖成像进行研究。所有三种类型的成像都是

相互关联的,其划分有些随意,但它们各自具有独特的特征。分子成像主要用于测量体内特定大分子或

代谢途径的水平或活性。功能成像致力于测量特定的功能,例如灌注和细胞密度。在组织的最

次上,解剖成像可以非常定量,并且可以识别微环境条件、表达和代谢表型中潜在的异质性。

细胞内和细胞外过程之间的这些复杂的相互作用导致内异质性,即表达和细胞表型是高度

可变的,即使在同一病变内也是如此。这种细胞异质性的是巨大且具有性的。例如,表型异质

性是进化速率的最重要因素。一个新兴概念,异质性最高的更容易适应化疗等干扰,因此预后

。由于选择(例自治疗),出现表型趋同。这种趋同可能是暂时的,并且不需要涉及

型的趋同。上,多个

genotypescanproducesimilarphenotypes.Suchtransientconvergenceatthephenotypescaleispreciselythe

sortofthingthatmodernimagingcanhighlight.

Intratumoralvariabilitydramaticallyconfoundsourabilitytostudyin-vivocancersbymolecular

diagnostics.Typicalmolecularcharacterizationssuchasmicroarraystudiesmeasurethetranscriptomeinalarge

numberofcells.Therelevanceofthissingle,averagemeasurementinapopulationofhighphenotypicand

genotypicvariancewilllikelybeverylimited.Insuchstudies,theimpactofheterogeneitycanonlybeappreciated

withlargedatasetsfromalargestudypopulation.Consequently,theapplicabilityofthesed

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