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基于序列相似性与磷酸化网络激酶-底物关系预测方法研究.pdfVIP

基于序列相似性与磷酸化网络激酶-底物关系预测方法研究.pdf

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    Preprintsofthe17thIFACSymposiumonSystemIdentification

    BeijingInternationalConventionCenter

    October19-21,2015.Beijing,

    ANovelKinase-substrateRelationPredictionMethodBasedonSubstrate

    SequenceSimilarityandPhosphorylationNetwork

    *****

    HaichunLi,XiaoyiXu,HuanqingFengandWang

    *SchoolofInformationScienceandTechnology,UniversityofScienceandTechnologyof,Hefei230027,

    **CentersforBiomedicalEngineering,UniversityofScienceandTechnologyof,

    Hefei,,(E-mail:mhwang@ustc.edu.cn)

    :Proteinphosphorylationcatalyzedbykinasesysessentialroinvariousintracellular

    processes.Therefore,theidentificationofpotentialrelationsweenkinasesandsubstratesisoneofthe

    keyareasinpost-translationalmodifications.Althoughanumberofcomputationalapproacheshavebeen

    designed,mostexistingkinase-substraterelation(KSR)predictionmethodsonlyfocusonproteinsequence

    informationwithoutconsideringkinase-substratenetwork.Inthispaper,weproposedanovelKSR

    predictionmethodcalledHeteSim-Sbasedbothsubstratesequencesimilarityandphosphorylation

    heterogeneousnetworkthroughHeteSimalgorithm,whichhasbeenusedinpreviousstudiesofsimilar

    search.Experimentresultsinkinase-

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