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基于嵌入图自编码器识别空间转录组学的空间域.pdf

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    摘要

    摘要

    空间转录组学作为一项新兴的技术手段，因其可以有效捕获基因表达数据

    的空间信息，为了解空间环境中的组织与功能提供了前所未有的机会。空间转

    录组学通过在组织切片中定位研究，可以保留组织切片上不同位置(spots)的空

    间位置信息，从而更加精准的识别组织空间域。在以往空间转录组学识别空间

    域的研究中存在两个问题：一、没有充分利用基因表达信息与空间位置信息；

    二、模型优化过程中将spots的低维嵌入与节点聚类过程

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