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药物分子结构与功能的研究新进展这是2025年最新研究成果汇总报告。我们将介绍从分子结构到临床应用的突破性进展。人工智能正在驱动药物研发领域的革命性变化，带来前所未有的机遇与挑战。汇报人：墨卷生香

研究背景分子结构决定功能药物分子的三维结构直接决定其在人体内的功能和疗效。技术显著提升近年来结构生物学技术取得突破性进展，为药物研发提供新工具。新型分子类型新型分子类型的出现极大扩展了药物可开发的化学空间。人工智能加速AI技术正在加速药物设计和优化过程，降低研发成本。

内在无序蛋白（IDPs）研究进展定义与功能内在无序蛋白不具有稳定的三维结构，但在细胞过程中发挥关键作用。它们参与信号转导、基因表达和蛋白质相互作用网络的调控。疾病关联IDPs异常凝聚物与阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾病密切相关。它们还参与多种癌症的发生发展过程。2025年已有多项针对IDPs的药物进入临床阶段，成为研究热点。

生物分子凝聚物靶向策略机制研究深入解析生物分子凝聚物在疾病发生中的作用机理。设计策略开发针对异常凝聚物的特异性药物设计策略。抑制剂研发合成并优化抑制凝聚物形成的小分子抑制剂。降解技术创新促进异常凝聚物降解的新方法与技术。

分子胶技术的突破1概念验证分子胶降解剂技术从理论概念逐步走向临床应用。2关键进展2024-2025年间取得多项关键技术突破。3效率提升实现皮摩尔级别的降解效率，远超传统药物。4协同治疗建立多靶点协同治疗的新范式，提高治疗效果。

分子内双价胶技术皮摩尔级降解效率实现超高效率的靶蛋白降解多结构域结合单一分子同时结合靶蛋白的多个区域特异性提升提高靶向特异性和结合亲和力安全性增强降低脱靶效应，提升药物安全性

双功能分子胶设计双靶点设计创新性设计同时靶向两种不同蛋白质的分子胶复杂疾病治疗在复杂疾病治疗中展现独特优势和效果协同效应利用靶点间的协同作用增强整体治疗效果降低耐药性多靶点作用机制有效降低耐药性的产生

IBG1分子胶案例分析双溴域结合IBG1分子胶能同时结合BRD4蛋白的两个溴域，提高结合力。这种结构设计显著增强了药物的特异性。蛋白降解机制将BRD4黏附到DCAF16泛素连接酶复合物上。通过泛素-蛋白酶体途径实现高效降解。抗肿瘤活性高效降解肿瘤驱动蛋白，阻断癌细胞生长信号。动物实验中显示显著的抗肿瘤活性和安全性。

CK1α降解剂研究进展PinTherapeutics研究成果该公司临床前研究显示CK1α降解剂具有显著疗效。正在准备进入临床I期试验阶段。三元复合物形成通过TR-FRET技术成功验证了降解剂诱导的三元复合物形成。证实了分子胶作用机制。高降解率动物实验中实现超过90%的CK1α降解率。显著抑制相关肿瘤生长。卓越治疗指数治疗指数达8,333，远超传统MDM2抑制剂。提供更宽安全窗口的治疗选择。

美国化学会2025年春季会议亮点会议首次公开12种临床候选药物分子结构，覆盖抗感染、抗癌、神经系统和心血管疾病领域。这些药物均基于结构导向设计，具有新颖骨架和作用机制。

离子通道调节剂的新发现Ebio2激活剂作为高活性激活剂，Ebio2能增强KCNQ2通道活性。其独特的结构特征使其选择性结合通道激活位点。Ebio3抑制剂作为高活性抑制剂，Ebio3能阻断KCNQ2通道功能。分子机制研究揭示其与通道蛋白的关键相互作用。治疗应用这对相反作用的调节剂为神经系统疾病提供新靶点。可用于癫痫、神经痛等多种神经系统疾病的精准治疗。

靶向蛋白质-蛋白质相互作用不可成药靶点突破成功靶向曾被认为不可成药的蛋白质相互作用界面小分子调节剂设计创新策略设计干扰蛋白质-蛋白质相互作用的小分子口服活性优化结构优化实现良好口服活性和药代动力学特性临床前验证多个模型中验证疗效，准备推进临床试验

人工智能在药物研发中的应用增强生物学理解AI技术帮助研究人员更全面地理解疾病相关生物学过程。发现新的治疗靶点和作用机制。加速分子设计AI显著加速不同类型药物分子的设计过程。在数百万分子中筛选最具潜力的候选化合物。提高转化成功率AI辅助预测药物在体内的行为和可能的副作用。减少临床失败风险，提高转化医学成功率。

基于结构预测的AI应用案例1小蛋白设计AI驱动的小蛋白设计取得突破性进展，创造新型治疗分子。细胞因子调控针对细胞因子的功能定向调控，提高特异性。靶向新结合位点AI识别并设计靶向新型结合位点的小分子化合物。药代动力学优化AI辅助优化药物分子的药代动力学特性，提高体内稳定性。

小蛋白设计创新60-100氨基酸数量设计包含60-100个氨基酸的稳定蛋白结构95%血清稳定性优化后的小蛋白在血清中表现出优异稳定性85%透膜率某些设计实现了高达85%的透膜效率99%病毒阻断率针对新冠病毒的小蛋白在体外实验中的阻断效率

细胞因子功能定向调控IL-2原型AI优化IL-2AI辅助设计显著