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小麦WRKY基因家族剖析:序列特征与白粉病菌诱导下的表达谱及抗病关联研究
一、引言
1.1研究背景与意义
小麦作为世界上最重要的粮食作物之一,为全球约35%-40%的人口提供主粮,在保障粮食安全方面具有举足轻重的地位。在中国,小麦是主要的粮食作物之一,其种植历史可追溯至数千年前的新石器时代。历经漫长岁月,小麦的种植范围不断扩大,如今在全国各地广泛种植,涵盖南方、北方以及高海拔的青藏高原等不同区域,不同地区的小麦品种和种植方式因气候和土地条件的差异而有所不同。作为北方地区的主要主食作物,小麦可制作成面条、馒头等丰富多样的面食,极大地满足了人们的饮食需求。此外,小麦的稳定产量对于维护国家的农产品供应稳定性和粮食安全意义非凡。在农业现代化进程中,小麦的品种改良、耕作技术以及农业机械化等方面的发展,对提高小麦产量和质量发挥了积极作用。不仅如此,中国的小麦在满足国内需求的同时,还在一定程度上作为农产品出口,并且小麦的种植技术、品种和经验也在国际合作中得以分享。
然而,小麦在生长过程中面临着诸多生物胁迫,其中白粉病是危害最为严重的病害之一。小麦白粉病是由专性寄生真菌禾本科布氏白粉菌小麦专化型(Blumeriagraminisf.sp.tritici)引起的一种气传性病害,在全球各小麦产区均有发生。该病在小麦的整个生育期均可发病,主要危害叶片,严重时也会侵害叶鞘、茎秆和穗部。发病初期,病部会出现分散的白色丝状霉斑,随着病情的发展,病斑逐渐连片,颜色变为浅灰色。这不仅严重影响叶片的光合作用,致使叶片褪绿、变黄乃至卷曲枯死,还会导致重病株分蘖数减少、不抽穗或穗短小,进而使小麦的成穗率降低、穗粒数减少、千粒重下降,最终对小麦的产量和品质产生极大的负面影响。例如,在一些白粉病高发地区,若防治不及时,小麦产量损失可达20%-50%,甚至更高。
植物在长期的进化过程中形成了一套复杂而精细的防御机制来应对病原菌的侵害,其中转录因子在植物抗病信号传导和防御基因表达调控中发挥着关键作用。WRKY基因家族是植物中最大的转录因子家族之一,其成员广泛参与植物的生长发育、衰老、激素信号传导以及生物和非生物胁迫响应等诸多生理过程。WRKY转录因子的结构特征是含有一个或两个高度保守的WRKY结构域,该结构域由大约60个氨基酸组成,其N-端含有高度保守的WRKYGQK氨基酸序列,C-端具有一个锌指结构。WRKY转录因子能够特异性地与靶基因启动子区域的W-box(T/CTGAC/T)顺式作用元件结合,从而调控下游基因的表达,在植物抗病过程中起着核心调控作用。大量研究表明,WRKY基因家族成员在植物对多种病原菌的防御反应中发挥着重要作用。例如,在拟南芥中,AtWRKY33参与了对灰霉病菌(Botrytiscinerea)的抗性反应;在水稻中,OsWRKY45正调控对稻瘟病菌(Magnaportheoryzae)的抗性。
深入研究小麦WRKY基因家族,对于揭示小麦抗白粉病的分子机制具有重要意义。一方面,通过全面解析小麦WRKY基因家族的序列特征、结构特点以及系统进化关系,可以为进一步研究其生物学功能提供坚实的基础。另一方面,分析白粉病菌诱导下小麦WRKY基因家族的表达谱变化,能够筛选出与抗白粉病相关的关键WRKY基因,进而深入探究其在小麦抗白粉病信号传导途径中的作用机制。这不仅有助于丰富我们对植物抗病分子机制的认识,还能为小麦抗病遗传改良提供具有重要价值的基因资源和理论依据,对培育高产、优质、抗病的小麦新品种,保障小麦安全生产和粮食安全具有重要的现实意义。
1.2国内外研究现状
在小麦WRKY基因家族序列分析方面,国内外学者已取得了一定的进展。国外研究团队较早开展了对小麦WRKY基因家族的生物信息学分析,通过对小麦全基因组序列的搜索和鉴定,初步确定了小麦WRKY基因家族的成员数量,并对其基因结构、保守结构域等进行了分析。国内研究人员在此基础上,进一步深入研究了小麦WRKY基因家族成员在不同染色体上的分布情况,发现其分布具有一定的规律性,部分染色体上WRKY基因相对集中。同时,通过多序列比对和系统发育分析,将小麦WRKY基因家族成员划分为不同的亚家族,明确了各亚家族成员之间的亲缘关系和进化特征。
关于白粉病菌诱导的小麦基因表达研究,目前主要采用转录组测序(RNA-seq)技术和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术。国外利用RNA-seq技术对小麦白粉病菌侵染后的转录组进行分析,筛选出了大量差异表达基因,其中包括多个WRKY基因。研究发现,这些WRKY基因在白粉病菌侵染后的不同时间点呈现出不同的表达模式,暗示它们在小麦抗白粉病过程中可能发挥
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