2001—2022年鸽圆环病毒的遗传变异分析.pdfVIP

男龙江言牧兽玉2024(01):109-116特种动物研究

DOI:10.13882023.04.0059

2001一2022年鸽圆环病毒的遗传变异分析

郎雯，陈煜杰，吴敏慧，苏梦容，阮莲，吕其壮1，2*

（1.玉林师范学院生物与制药学院，广西玉林537000;2.广西农产资源化学与生物技术重点实验室，广西玉林537000）

中图分类号：S851.3文献标识码：A文章编号：1004-7034(2024)01-0109-08

摘要：鸽圆环病毒（Pigeoncircovirus,PiCV）是近几年发现的一种能引起感染鸽免疫抑制的病毒，属于圆环病毒科圆

环病毒属。为研究PiCV的流行特征和遗传进化规律，试验从GenBank中选取208株PiCV全基因组序列，利用生物信

息学软件，通过构建PiCV全基因组系统发育树,进行核苷酸同源性比较、氨基酸序列比对分析、抗原表位分析和基因

重组等方式对其进行遗传变异分析。结果表明：基于构建的系统发育树可将208株PiCV毒株分为A（54.81%，

114/208）和B(45.19%,94/208）两个基因型，其中A基因型可进一步分为A-1、A-2、A-3、A-4、A-55个不同的亚

群,B基因型可进一步分为B-1、B-2、B-3、B-44个不同的亚群。208株PiCV全基因组序列的相似性为83.8%~

100%。PiCVCap蛋白氨基酸序列上存在氨基酸的点突变、缺失和插入等情况。208株PiCV全基因组序列中存在大

量重组事件（44个），涉及A基因型序列中所包含的遗传物质的直接交换及ORFC1基因小片段的转移。说明PiCV

的变异具有多样性。

关键词：鸽圆环病毒（PiCV）；遗传变异分析；重组分析；系统发育树；氨基酸序列分析

AnalysisofthegeneticvariationinPigeoncircovirusfrom2001to2022

12*

LANGWen,CHENYujie,WUMinhui,SUMengrong,RUANLian,LYUQizhuang

(1.CollegeofBiologyPharmacy,YulinNormalUniversity,Yulin537000,China;

2.GuangxiKeyLaboratoryofAgriculturalResourcesChemistryandBiotechnology,Yulin537000,China)

Abstract:Pigeoncircovirus(PiCV)isavirusfoundinrecentyearsthatcancauseimmunosuppressionininfectedpigeons.Itbelongstothe

genusCircovirusofthecircoviridaefamily.InordertostudytheepidemiccharacteristicsandgeneticevolutionofPiCV,thewholegenome

sequencesof208PiCVstrainswereselectedfromGenBankdatabaseandbioinformaticssofwarewasusedintheexperiment.Thegenetic

variationofPicVwasanalyzedby