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HLA-I类基因位于6号染色顶端经典HLA-I类基因：包括A、B、C三个基因座位，编码三组高免疫性、高度多态性的HLA-A、HLA-B、HLA-C糖蛋白分子。非经典HLA-I类基因：免疫功能关基因，包括E、F、G、H、J基因座位，编码免疫性和多态性均较低的分子HLA复合体HLA-II类基因位于6号染色着丝点经典HLA-II类基因（DP、DQ、DR）编码HLA-II类分子；非经典的HLA-II类基因（LMP、TAP、DM）为与抗原加工和递呈有关的基因。HLA复合体HLA-III类基因位于II类和I类基因中段经典HLA-III类基因编码产生C4、C2、B因子等HLA复合体HL
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