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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪个数据库主要用于存储和注释人类遗传变异的临床意义?
A.GEO(基因表达综合数据库)
B.ClinVar(临床变异数据库)
C.dbSNP(单核苷酸多态性数据库)
D.TCGA(癌症基因组图谱)
答案:B
解析:ClinVar由NCBI维护,专注于收集变异的临床意义(如致病性、可能致病性等);GEO主要存储基因表达数据,dbSNP侧重变异频率而非临床意义,TCGA是癌症多组学数据,因此选B。
单核苷酸变异(SNP)是指:
A.长度≥50bp的DNA片段插入或缺失
B.单个核苷酸的替换、插入或缺失
C.染色体数目异常(如三倍体)
D.基因拷贝数的扩增或缺失
答案:B
解析:SNP定义为单个核苷酸位置的变异(替换、插入或缺失),长度通常≤1bp;A是Indel(插入缺失),C是染色体数目异常,D是CNV(拷贝数变异),故B正确。
全外显子测序(WES)主要覆盖的区域是:
A.基因组中所有编码蛋白质的外显子区域
B.线粒体DNA的全部序列
C.非编码RNA(如miRNA)的基因区域
D.启动子和增强子等调控区域
答案:A
解析:WES通过探针捕获基因组中约1-2%的外显子区域(编码蛋白质的区域),其他选项分别对应线粒体测序、非编码RNA测序和全基因组测序的部分内容,因此选A。
同义突变是指:
A.导致蛋白质氨基酸序列改变的突变
B.不改变蛋白质氨基酸序列的突变
C.引起阅读框移位的突变
D.导致提前终止密码子的突变
答案:B
解析:同义突变因遗传密码简并性,突变后密码子编码的氨基酸不变,不改变蛋白质序列;A是错义突变,C是移码突变,D是无义突变,故B正确。
以下哪个指标用于评估测序数据的碱基质量?
A.测序深度(Depth)
B.Q30比例
C.比对率(MappingRate)
D.覆盖度(Coverage)
答案:B
解析:Q30指测序碱基质量值≥30的比例(错误率≤0.1%),是评估碱基准确性的核心指标;A是每个位置的平均测序次数,C是比对到参考基因组的reads比例,D是目标区域被覆盖的比例,故B正确。
肿瘤体细胞变异解读中,“驱动变异”是指:
A.仅存在于肿瘤组织中的变异
B.促进肿瘤发生发展的功能性变异
C.遗传自父母的胚系变异
D.无明确功能的中性变异
答案:B
解析:驱动变异(Driver)是直接促进肿瘤发生的变异(如EGFR激活突变);A是体细胞变异的定义,C是胚系变异,D是乘客变异(Passenger),故B正确。
HGVS命名法中,“c.123AT”表示:
A.染色体123号位置A突变为T
B.线粒体DNA第123位A突变为T
C.编码RNA(cRNA)第123位A突变为T
D.编码DNA(cDNA)第123位A突变为T
答案:D
解析:HGVS中“c.”表示编码DNA(cDNA)的位置,“g.”为基因组DNA,“m.”为线粒体DNA,故D正确。
以下哪种变异通常不会通过一代测序(Sanger)验证?
A.单核苷酸替换(SNP)
B.小片段插入缺失(Indel,≤50bp)
C.拷贝数变异(CNV,≥1kb)
D.已知热点突变(如BRAFV600E)
答案:C
解析:Sanger测序适用于短片段(≤1000bp)的精准验证,CNV需通过qPCR、FISH或芯片检测,故C正确。
孟德尔遗传病变异解读中,“常染色体隐性遗传”要求:
A.患者为杂合变异(仅1个等位基因致病)
B.患者需两个等位基因均携带致病变异
C.变异位于X染色体且男性半合子发病
D.变异由父亲传递给所有女儿
答案:B
解析:常染色体隐性遗传病需患者同时携带两个致病等位基因(纯合或复合杂合);A是显性遗传,C是X连锁隐性,D是X连锁显性,故B正确。
基因数据解读中,“意义未明变异(VUS)”的主要特征是:
A.已明确为致病性变异
B.已明确为良性变异
C.缺乏足够证据判断临床意义
D.仅存在于肿瘤组织中的变异
答案:C
解析:VUS(VariantofUncertainSignificance)指现有证据(频率、功能、家系等)不足以支持致病或良性的变异,故C正确。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于二代测序(NGS)质量控制的关键指标有:
A.Q30比例
B.测序深度(Depth)
C.基因表达量(FPKM)
D.比对率(MappingRate)
答案:ABD
解析:Q30评估碱基质量,Depth评估覆盖均一性,MappingRate评估数据有效性;基因表达量(C)是RNA-seq的指标,与DNA测序无关,故正确选项为ABD。
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