2025年生物信息分析师考试题库(附答案和详细解析)(1217).docxVIP

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生物信息分析师考试试卷

一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)

FASTQ文件的典型结构包含以下哪项?

A.仅序列标识符和核苷酸序列

B.序列标识符、核苷酸序列、质量值行

C.基因注释信息

D.三维结构模型

答案:B

解析:FASTQ文件是高通量测序数据的标准存储格式,每行四组数据:第一行以@开头的序列标识符,第二行是核苷酸序列,第三行以+开头(可重复标识符),第四行是对应序列的质量值(ASCII编码)。选项A描述的是FASTA文件的结构;C和D属于其他类型文件(如GFF/GTF或PDB文件)的内容,因此错误。

以下哪项是短读长测序数据的常用比对工具?

A.BWA

B.InterProScan

C.Trinity

D.GATK

答案:A

解析:BWA(Burrows-WheelerAligner)是经典的短读长(如Illumina数据)比对工具,通过Burrows-Wheeler变换实现高效比对。B是功能注释工具,C是转录组组装工具,D是变异检测工具,均错误。

RNA-seq差异表达分析中,适用于处理计数数据的统计模型是?

A.正态分布

B.泊松分布

C.负二项分布

D.卡方分布

答案:C

解析:RNA-seq数据因技术重复的变异性(过离散),通常用负二项分布(DESeq2、edgeR)建模;泊松分布假设均值等于方差,无法处理过离散,故错误;正态分布适用于连续数据,卡方分布用于分类变量检验,均不适用。

基因组组装中,“k-mer”指的是?

A.测序读长的长度

B.序列中连续k个核苷酸的子序列

C.组装后的连续序列片段

D.基因编码区的平均长度

答案:B

解析:k-mer是将测序读长(read)切割为长度为k的重叠子序列,用于计算k-mer频率以评估基因组复杂度和重复区域。A是读长(readlength),C是contig,D是CDS长度,均错误。

以下哪种文件格式用于存储基因组比对结果的二进制压缩版本?

A.FASTQ

B.BAM

C.VCF

D.GTF

答案:B

解析:BAM(BinaryAlignment/Map)是SAM(SequenceAlignment/Map)的二进制压缩格式,用于存储测序读长与参考基因组的比对结果。A是原始测序数据,C是变异数据,D是基因注释数据,均错误。

单核苷酸多态性的缩写是?

A.CNV

B.SNP

C.InDel

D.SV

答案:B

解析:SNP(SingleNucleotidePolymorphism)指单核苷酸变异;CNV是拷贝数变异,InDel是插入缺失,SV是结构变异,均错误。

以下属于非编码RNA的是?

A.mRNA

B.tRNA

C.rRNA

D.miRNA

答案:D

解析:miRNA(微小RNA)是非编码RNA,参与基因表达调控;mRNA、tRNA、rRNA均直接参与蛋白质合成,属于编码或功能性RNA,故错误。

基因本体(GeneOntology)数据库主要用于?

A.基因组序列比对

B.基因功能富集分析

C.蛋白质结构预测

D.变异位点注释

答案:B

解析:GO数据库通过分子功能(MF)、细胞组分(CC)、生物学过程(BP)三个维度注释基因功能,常用于富集分析;A是比对工具功能,C是SWISS-MODEL等工具功能,D是VEP等工具功能,均错误。

宏基因组学的主要研究对象是?

A.单一物种的全基因组

B.环境中的微生物群落

C.肿瘤细胞的基因突变

D.模式生物的转录组

答案:B

解析:宏基因组学(Metagenomics)直接测序环境样本(如肠道、土壤)中的微生物混合DNA,研究群落组成及功能;A是基因组学,C是肿瘤基因组学,D是转录组学,均错误。

Phred质量分数Q=30对应的碱基错误概率是?

A.0.1%

B.1%

C.10%

D.0.01%

答案:A

解析:Phred质量分数公式为Q=-10×log??(P),其中P为错误概率。Q=30时,P=10^(-30/10)=0.001(0.1%),故正确;B对应Q=20,C对应Q=10,D对应Q=40,均错误。

二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)

高通量测序数据质量控制(QC)的主要步骤包括?

A.去除接头序列

B.过滤低质量reads

C.比对到参考基因组

D.去除污染(如宿主DNA)

答案:ABD

解析:质控的核心是确保数据可靠性,主要步骤包括:A(接头序列可能干扰后续分析,需用Cutadapt等工具去除);B(质量分数低于阈值的reads需过滤,常用Fastp或Trimmomatic);D(如人样本中污染的人源DNA需用Bowtie2比对后去除)。C是比对步骤,属于下游分析,不属于质控环节,因

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