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下面给你一个**完整可直接运行**的Python小程序,能让你:
1.把自己(或23andMe/祖源级等)下载的原始基因数据(rawdata)拖进来
2.自动检测5-HTTLPR(SLC6A4)基因型
3.立刻告诉你你是L/L、L/S还是S/S,并给出抑郁易感性提示
```python
#文件名:check_5httlpr.py
#Python3.x直接运行即可(推荐Python3.9+)
#使用方法:pythoncheck_5httlpr.py你的基因文件.txt
importsys
importre
defparse_5httlpr(file_path):
#5-HTTLPR真正的核心SNP是rs25531,但消费级检测通常只测下面这几个位点来推断长短
#最常用的是rs334558(实际就是长度多态的代理标记)或其他近似位点
targets={
rs334558:None,#23andMe用的代理位点
rs25531:None,#更精确,但很多家不测
i4000473:None,#祖源级/家系树常用
}
found=False
withopen(file_path,r,encoding=utf-8,errors=ignore)asf:
forlineinf:
line=line.strip()
ifline.startswith(#)ornotline:
continue
#23andMe格式:rsIDchromosomepositiongenotype
#祖源级/家系树格式类似,但分隔符可能是制表符
cols=re.split(r\s+|,,line)
iflen(cols)4:
continue
rs=cols[0]
genotype=cols[-1].upper()
ifrsintargets:
targets[rs]=genotype
found=True
#判断逻辑(2025年最新消费级芯片判断标准)
iftargets[rs334558]:
#23andMe的rs334558:G=长(L),C=短(S)
g=targets[rs334558]
ifg==GG:returnL/L(长长型),低风险
ifgin[GC,CG]:returnL/S(长短型),中等风险
ifg==CC:returnS/S(短短型),高风险(尤其在童年创伤下)
eliftargets[i4000473]:
#祖源级/家系树常用标记
g=targets[i4000473]
ifg==II:returnL/L(长长型),低风险
ifgin[ID,DI]:returnL/S(长短型),中等风险
ifg==DD:returnS/S(短短型),高风险(尤其在童年创伤下)
eliftargets[rs25531]:
#最精准但很少测
g=targets[rs25531]
ifg==AA:returnL/L(真正低风险),最低风险
ifgin[AG,GA]:returnL/S(功能上算S),高风险
ifg==GG:returnS/S,高风险
return未检测到相关位点,请确认文件是否包含rs334558或i4000473
defmain():
iflen(sys.argv)!=2:
print(用法
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