下面给你一个完整可直接运行的 Python 小程序,能让你:.docxVIP

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下面给你一个**完整可直接运行**的Python小程序,能让你:

1.把自己(或23andMe/祖源级等)下载的原始基因数据(rawdata)拖进来

2.自动检测5-HTTLPR(SLC6A4)基因型

3.立刻告诉你你是L/L、L/S还是S/S,并给出抑郁易感性提示

```python

#文件名:check_5httlpr.py

#Python3.x直接运行即可(推荐Python3.9+)

#使用方法:pythoncheck_5httlpr.py你的基因文件.txt

importsys

importre

defparse_5httlpr(file_path):

#5-HTTLPR真正的核心SNP是rs25531,但消费级检测通常只测下面这几个位点来推断长短

#最常用的是rs334558(实际就是长度多态的代理标记)或其他近似位点

targets={

rs334558:None,#23andMe用的代理位点

rs25531:None,#更精确,但很多家不测

i4000473:None,#祖源级/家系树常用

}

found=False

withopen(file_path,r,encoding=utf-8,errors=ignore)asf:

forlineinf:

line=line.strip()

ifline.startswith(#)ornotline:

continue

#23andMe格式:rsIDchromosomepositiongenotype

#祖源级/家系树格式类似,但分隔符可能是制表符

cols=re.split(r\s+|,,line)

iflen(cols)4:

continue

rs=cols[0]

genotype=cols[-1].upper()

ifrsintargets:

targets[rs]=genotype

found=True

#判断逻辑(2025年最新消费级芯片判断标准)

iftargets[rs334558]:

#23andMe的rs334558:G=长(L),C=短(S)

g=targets[rs334558]

ifg==GG:returnL/L(长长型),低风险

ifgin[GC,CG]:returnL/S(长短型),中等风险

ifg==CC:returnS/S(短短型),高风险(尤其在童年创伤下)

eliftargets[i4000473]:

#祖源级/家系树常用标记

g=targets[i4000473]

ifg==II:returnL/L(长长型),低风险

ifgin[ID,DI]:returnL/S(长短型),中等风险

ifg==DD:returnS/S(短短型),高风险(尤其在童年创伤下)

eliftargets[rs25531]:

#最精准但很少测

g=targets[rs25531]

ifg==AA:returnL/L(真正低风险),最低风险

ifgin[AG,GA]:returnL/S(功能上算S),高风险

ifg==GG:returnS/S,高风险

return未检测到相关位点,请确认文件是否包含rs334558或i4000473

defmain():

iflen(sys.argv)!=2:

print(用法

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