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人去乙酰化酶SIRT1的基因克隆及在大肠杆菌中的表达
一、研究背景与意义
去乙酰化酶SIRT1是一种依赖于NAD+的去乙酰化酶,在细胞的多种生理过程中发挥着至关重要的作用。它参与了细胞衰老、能量代谢、应激反应等多种生物学过程的调控,与多种疾病的发生发展密切相关,如癌症、神经退行性疾病、代谢综合征等。
对人去乙酰化酶SIRT1进行基因克隆及在大肠杆菌中的表达研究,具有重要的理论和实际意义。从理论上讲,这有助于深入了解SIRT1的结构与功能之间的关系,探索其在各种生理和病理过程中的作用机制。从实际应用来看,获得大量的重组SIRT1蛋白可以为相关疾病的诊断、治疗以及药物筛选提供重要的物质基础。
二、基因克隆
(一)材料与试剂
模板:含有人类SIRT1基因的cDNA文库。
引物:根据GenBank中公布的人SIRT1基因序列设计特异性引物,上游引物引入限制性内切酶位点(如BamHⅠ),下游引物引入另一种限制性内切酶位点(如HindⅢ),以便后续的载体连接。
酶类:TaqDNA聚合酶、限制性内切酶(BamHⅠ和HindⅢ)、T4DNA连接酶等。
载体:pET-28a(+)质粒,该载体含有His标签,便于重组蛋白的纯化。
其他试剂:dNTPs、DNA分子量标准、琼脂糖、胶回收试剂盒、质粒提取试剂盒等。
(二)方法
PCR扩增目的基因
反应体系:按照一定比例混合cDNA模板、上下游引物、dNTPs、TaqDNA聚合酶及相应的缓冲液。
反应条件:95℃预变性5min;然后95℃变性30s,55-60℃退火30s,72℃延伸2min,进行30个循环;最后72℃延伸10min。
扩增产物检测:通过琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物的大小和纯度,使用胶回收试剂盒回收目的片段。
目的基因与载体的酶切
分别对回收的SIRT1目的基因和pET-28a(+)质粒进行BamHⅠ和HindⅢ双酶切。
酶切体系:按照酶的说明书配置,包含目的基因或质粒、两种限制性内切酶、相应的缓冲液,37℃水浴反应数小时。
酶切产物回收:使用胶回收试剂盒回收酶切后的目的基因和载体片段。
连接反应
用T4DNA连接酶将酶切后的SIRT1目的基因与pET-28a(+)载体按照一定的摩尔比例混合,在16℃条件下连接过夜。
转化
将连接产物转化到感受态大肠杆菌DH5α中,具体步骤为:将连接产物与感受态细胞混合,冰浴30min,42℃热激90s,立即冰浴2min,加入LB液体培养基,37℃振荡培养1h。
取适量培养物涂布于含有卡那霉素的LB固体培养基上,37℃培养过夜,筛选阳性克隆。
阳性克隆鉴定
挑取单菌落接种到含有卡那霉素的LB液体培养基中,37℃振荡培养过夜。
提取质粒,进行双酶切鉴定和测序分析,验证目的基因是否正确插入载体中。
三、在大肠杆菌中的表达
(一)材料与试剂
菌株:含有重组质粒pET-28a(+)-SIRT1的大肠杆菌BL21(DE3)。
培养基:LB液体培养基(含卡那霉素)。
诱导剂:IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷)。
其他试剂:蛋白质分子量标准、SDS-PAGE相关试剂、Westernblot相关试剂(抗His标签抗体等)。
(二)方法
重组菌的培养与诱导表达
将鉴定正确的重组质粒转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,挑取单菌落接种到含有卡那霉素的LB液体培养基中,37℃振荡培养至OD600nm为0.6-0.8。
加入IPTG至终浓度为0.5-1mmol/L,在25-37℃条件下继续振荡培养3-6h,诱导SIRT1蛋白的表达。同时设置未诱导的重组菌和空载体转化的菌作为对照。
蛋白的提取
取诱导后的菌液,4℃离心收集菌体,用PBS缓冲液洗涤菌体2-3次。
加入适量的裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂),超声破碎菌体(冰浴条件下),4℃离心,分别收集上清和沉淀。
SDS-PAGE分析
对提取的蛋白样品进行SDS-PAGE电泳,电泳结束后进行考马斯亮蓝染色,观察目的蛋白的表达情况,包括表达量和存在形式(上清或沉淀中)。
Westernblot鉴定
将SDS-PAGE电泳后的蛋白转移到硝酸纤维素膜上,用5%脱脂奶粉封闭过夜。
加入抗His标签的一抗,室温孵育2h,洗膜后加入二抗,室温孵育1h,再次洗膜,最后通过化学发光显色检测目的蛋白。
四、结果与分析
(一)基因克隆结果
PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳分析,得到与预期大小相符的SIRT1目的基因片段,表明PCR扩增
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