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SSR分子标记解析紫花、杂花与黄花苜蓿的遗传密码

一、引言

1.1研究背景与意义

苜蓿作为世界上最重要的豆科牧草之一，素有“牧草之王”的美誉，在全球饲草产业中占据着举足轻重的地位。其不仅蛋白质含量高，富含多种维生素和矿物质，而且具有良好的适口性和消化率，是各类家畜优质的饲料来源。随着畜牧业的快速发展，对苜蓿的需求日益增长，优质苜蓿资源的开发与利用成为保障畜牧业可持续发展的关键因素。

紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿是苜蓿属中的重要类群。紫花苜蓿以其高产、优质的特点，成为广泛种植的苜蓿品种；杂花苜蓿具有复杂的遗传背景和多样的生态适应性；黄花苜蓿则在抗寒、抗旱等逆境条件下表现出独特的优势。深入了解这三种苜蓿的遗传特性，对于充分挖掘苜蓿种质资源潜力、培育优良品种具有重要的理论和实践意义。

SSR（SimpleSequenceRepeat）分子标记技术，即简单序列重复标记技术，作为一种高效、准确的分子生物学手段，在植物遗传研究领域得到了广泛应用。SSR标记具有多态性高、共显性遗传、重复性好、操作简便等优点，能够直接反映基因组DNA水平的差异。利用SSR分子标记技术对紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿进行分析，可以准确揭示它们的遗传多样性、亲缘关系以及群体遗传结构，为苜蓿种质资源的保护、评价和利用提供坚实的数据基础。

在苜蓿资源保护方面，通过SSR分子标记分析，可以明确不同苜蓿材料的遗传特性，识别出独特的遗传资源，为制定科学合理的保护策略提供依据，避免珍贵种质资源的流失。在苜蓿育种工作中，了解不同苜蓿品种间的亲缘关系，有助于合理选配亲本，提高杂交育种的成功率，加速培育出具有高产、优质、抗逆等优良性状的新品种，满足畜牧业不断发展的需求。因此，开展紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿的SSR分子标记分析研究具有重要的现实意义，对推动苜蓿产业的健康发展具有深远影响。

1.2国内外研究现状

在国外，SSR分子标记技术在苜蓿遗传研究方面起步较早，取得了一系列丰富的成果。在紫花苜蓿研究上，德国学者运用19个SSR标记对104个紫花苜蓿品种展开遗传多样性分析，结果表明这些品种遗传多样性和遗传距离较大，并划分成四个群体，其中两个群体内的品种地理来源和形态特征相似。匈牙利的研究人员利用11个SSR标记对27个紫花苜蓿品种进行人工授粉试验和遗传多样性分析，发现这些品种遗传多样性较低，强调了加强保护和利用的必要性。

针对杂花苜蓿，捷克和斯洛伐克的研究者使用20个SSR标记对119个杂花苜蓿品种进行分析，发现其遗传多样性较高且具有较强的地理相关性和形态特征。澳大利亚的科研团队对44个杂花苜蓿品种采用11个SSR标记分析，结果显示这些品种遗传多样性较大，可分为几个遗传群体，且存在显著的地理和环境差异。

在黄花苜蓿研究中，塞尔维亚的科学家利用7个SSR标记对25个黄花苜蓿品种进行遗传多样性分析，发现品种间遗传多样性和遗传距离较大，可分为几个遗传群体，部分品种地理相关性较强。伊朗的研究人员使用12个SSR标记对60个黄花苜蓿品种分析后发现，这些品种遗传多样性较低，地理和形态特征相似性较强。

国内对于苜蓿SSR分子标记的研究也在不断深入。有研究利用SSR标记对抗蚜苜蓿品系进行遗传多样性分析，并建立了可行的SSR体系，为抗蚜苜蓿选育提供基础数据。在紫花苜蓿与黄花苜蓿杂种分析及SNP标记遗传图谱构建研究中，通过SSR分子标记鉴定杂种真伪性，对杂交后代农艺性状变异情况进行探讨，为苜蓿杂种遗传变异分析、数量性状QTL定位以及分子标记辅助育种奠定基础。还有研究以36份新疆野生黄花苜蓿为材料，采用SSR分子标记对其遗传多样性进行分析，结果表明居群间存在丰富的遗传多样性。

然而，当前研究仍存在一些不足之处。一方面，对于不同生态区域的紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿的遗传多样性分析还不够全面，尤其在一些特殊生态环境下的苜蓿资源研究较少。另一方面，在利用SSR分子标记进行苜蓿亲缘关系分析时，部分研究样本数量有限，导致结果的普适性受到一定影响。此外，将SSR分子标记技术与其他先进技术相结合，深入研究苜蓿遗传机制的相关报道相对较少。本研究将在已有研究的基础上，扩大样本采集范围，综合运用多种分析方法，深入开展紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿的SSR分子标记分析，以期为苜蓿种质资源研究提供更全面、深入的信息。

1.3研究目标与内容

本研究旨在利用SSR分子标记技术，深入分析紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿的遗传多样性、亲缘关系以及群体遗传结构，为苜蓿种质资源的保护、评价和利用提供科学依据。具体研究内容包括：

材料选择：广泛收集不同地理来源的紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿材