分子动力学模拟实例扩散系数7.ppt

分子动力学模拟实例聚合物中分子扩散系数的计算模拟

分子动力学做扩散系数有两种方法：

1.计算体系的均方位移（MeansquaredisplacementＭＳＤ），然后根据Einstein关系求得扩散系数；

2.计算体系的速度自关联函数（Velocityauto-correlationfunctionVACF)然后再通过Green-kubo关系计算体系的扩散系数

1、Gettingstarted

BeginbystartingMaterialsStudioandcreatinganewproject.OpentheNewProjectdialogandenterpolymer_gasastheprojectname,clicktheOKbutton.Thenewprojectiscreatedwithpolymer_gaslistedintheProjectExplorer.

2.Tosetuptheinitialstructures

3.TobuildanamorphouscellClicktheAmorphousCellbuttonontheModulestoolbarandselectConstructionfromthedro