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- 2026-03-11 发布于上海
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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种文件格式同时包含序列信息和质量分数?
A.FASTA
B.FASTQ
C.GTF
D.BED
答案:B
解析:FASTA格式仅包含序列标识符和序列本身(无质量信息);FASTQ格式在FASTA基础上增加了质量分数(通过ASCII字符表示);GTF(基因转移格式)用于注释基因结构;BED(浏览器扩展数据)用于描述基因组区间。因此正确答案为B。
以下工具中,专门用于基因组变异检测(如SNP/Indel)的是?
A.BLAST
B.Bowtie2
C.GATK
D.FastQC
答案:C
解析:BLAST用于序列相似性搜索;Bowtie2是短序列比对工具;GATK(基因组分析工具包)是经典的变异检测工具;FastQC用于原始测序数据质量控制。因此正确答案为C。
在RNA-seq分析中,“FPKM”指标用于衡量?
A.测序数据的错误率
B.基因的表达量
C.序列比对的准确率
D.基因组的覆盖深度
答案:B
解析:FPKM(每百万映射reads的外显子每千碱基的碎片数)是标准化后的基因表达量计算指标;测序错误率通常用Q值衡量;比对准确率通过比对率统计;覆盖深度用平均覆盖倍数(X)表示。因此正确答案为B。
以下数据库中,主要存储蛋白质相互作用信息的是?
A.GenBank
B.Ensembl
C.STRING
D.dbSNP
答案:C
解析:GenBank是核酸序列数据库;Ensembl提供基因组注释;STRING是蛋白质-蛋白质相互作用数据库;dbSNP存储单核苷酸多态性信息。因此正确答案为C。
三代测序技术(如PacBio)的主要优势是?
A.测序成本低
B.读长更长
C.错误率更低
D.通量更高
答案:B
解析:三代测序(如PacBio、Nanopore)的核心优势是单分子测序,读长可达数kb至Mb级;二代测序(如Illumina)成本低、通量高但读长较短(50-300bp);三代测序错误率较高(约15%),需通过纠错提高准确性。因此正确答案为B。
在生信分析中,“QC”通常指?
A.定量分析(QuantitativeAnalysis)
B.质量控制(QualityControl)
C.序列比对(QueryComparison)
D.功能注释(FunctionCuration)
答案:B
解析:QC是QualityControl的缩写,指对测序数据或分析结果进行质量检查;定量分析常用“Quantification”表示;序列比对用“Alignment”;功能注释用“Annotation”。因此正确答案为B。
以下哪项不是BAM文件的特点?
A.二进制压缩格式
B.包含比对位置信息
C.可直接用文本编辑器查看
D.通常与索引文件(.bai)配合使用
答案:C
解析:BAM是SAM(序列比对格式)的二进制压缩版本,无法直接用文本编辑器查看(需通过samtoolsview转换为SAM);BAM包含比对位置、质量、比对标记等信息,需配合.bai索引文件加速随机访问。因此正确答案为C。
在系统发育树构建中,“NJ算法”指?
A.最大似然法(MaximumLikelihood)
B.邻接法(Neighbor-Joining)
C.最大简约法(MaximumParsimony)
D.贝叶斯推断(BayesianInference)
答案:B
解析:邻接法(Neighbor-Joining,NJ)是基于距离矩阵构建系统发育树的常用算法;最大似然法(ML)基于概率模型;最大简约法(MP)寻找最短进化路径;贝叶斯推断(BI)通过后验概率评估树结构。因此正确答案为B。
以下哪种工具用于基因功能富集分析?
A.DESeq2
B.GOEAST
C.HISAT2
D.Trimmomatic
答案:B
解析:DESeq2用于RNA-seq差异表达分析;GOEAST(基因本体富集分析工具)用于GO/KEGG功能富集;HISAT2是RNA-seq比对工具;Trimmomatic用于原始数据修剪(去除接头和低质量序列)。因此正确答案为B。
单细胞RNA-seq(scRNA-seq)的主要特点是?
A.仅检测mRNA
B.可解析细胞异质性
C.无需扩增cDNA
D.测序通量远高于bulkRNA-seq
答案:B
解析:scRNA-seq通过单细胞分离技术(如微流控)捕获单个细胞的转录组,可解析群体细胞中的异质性(如肿瘤微环境中的不同细胞亚群);需通过cDNA扩增(如MDA或PCR)提高检测灵敏度;测序通量低于bulkRNA-seq(因单个细胞RNA量少);除mRNA外也可检测lncRNA
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