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分子植物育种，2023年，第21卷，第9期，第2908-2924页

MolecularPlantBreedingNo.9,2908-2924

研究报告

ResearchReport

檀香科半寄生植物叶绿体基因组比较与进化分析

2丁宇1唐敏强！谢尚潜

王马寅！张晓明2

1

*通信作者，sqianxie@hainanu.edu.cn

摘要檀香科植物具有极高的观赏价值与经济价值，其中大多数为半寄生物种，包括兼性半寄生与专性半

寄生类型，在半寄生类植物系统发育研究中具有重要的地位。本研究以檀香科12个半寄生物种叶绿体基因

组序列为研究对象，分析其基因组基本特征、基因组比较以及系统进化关系。结果表明：(1)基因组特征分析

方面：与典型的被子植物叶绿体基因组相比，檀香科半寄生物种叶绿体基因组略有缩短。檀香科物种密码子

偏好性与其他陆生植物一致，密码子第三位更偏好A或T。重复序列和SSR序列鉴定结果表明，寄生属物

种与其他物种在序列数目和长度上存在差异。(2)基因组比较分析发现，部分檀香科植物IR区域扩张引起了

LSC-IR边界改变,IR-SSC区域差异是边界处基因区域倒置的结果。此外，部分蛋白编码基因(ndh,infA，matK,

rpl33和ccsA)被假基因化或完全缺失。(3)基于叶绿体全基因组