益生菌菌株鉴定 全基因组测序法.pdfVIP

GB/TXXXXXXXXX

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附录A

（资料性）

益生菌菌株鉴定全基因组测序法

A.1原理

采用高通量测序技术测定待鉴定菌株基因组序列，并与近缘模式菌株、参考菌株基因组序列进行比

对，通过平均核苷酸一致性（AverageNucleotideIdentity，ANI）和单核苷酸多态性（SingleNucleotide

Polymorphism，SNP）差异分析，进行菌株鉴定。

A.2试剂或材料

A.2.1细菌基因组DNA提取试剂盒。

A.2.2文库制备试剂。

A.2.3高通量测序试剂。

A.3仪器设备

A.3.1生物安全柜。

A.3.2电子显微镜。

A.3.3恒温水浴锅或金属浴。

A.3.4核酸定量仪。

A.3.5高通量基因测序仪。

A.3