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基于环境宏基因组的催化功能酶基因高效筛选体系

目录

一、研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．2

二、高效筛选体系核心构建原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

三、体系构成要素．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

3.1微生物样本筛选与靶向富集策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

3.2原始宏基因组数据预处理模块设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

3.3催化活性基因指纹图谱建立方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.4差异表达基因与功能富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.5酶催化潜能预测算法开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

3.6并行计算与高性能筛选平台．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

四、核心技术路径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

4.1宏基因组测序数据质量控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

4.2基于KEGG/CAZy/BRITE等数据库注释策略．