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基于GPU与压缩索引：新一代测序数据再测序的深度探索与创新实践

一、引言

1.1研究背景与意义

1.1.1新一代测序技术的发展与挑战

自20世纪70年代中期第一代测序技术诞生以来，基因组测序技术取得了重大进展。Sanger测序法作为第一代测序技术，在人类基因组计划前期发挥了关键作用，然而其通量较低、成本高昂的局限性，难以满足大规模基因组学研究的需求。进入21世纪，以Illumina公司的Solexa技术、ABI公司的SOLiD技术和454LifeSciences公司的焦磷酸测序技术为代表的新一代测序技术应运而生，开启了高通量测序新时代。这些技术采用边合成