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微生物代谢网络重构与目标产物定向合成策略

目录

一、把控基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．2

1.1后基因组时期的代谢大数据获取与管理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．2

1.2基于全基因组水平的代谢通路图谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.3现有代谢能力的基因元件识别与功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.4代谢网络拓扑结构与关键节点识别分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.5潜在非自然代谢能力的生物信息学预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

二、定制路径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.1目标化合物的结构解析与前体确定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.2denovo从头设计或途径拆分优化策略制定．．．．．．．．．．．．．．13

2.3关键催化元件的识别、筛选与改造．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.4合成途径的标准化元件化组装方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

2.5不同层级的in．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

三、精准调控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．