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高等学校化学学报

CHEMICALJOURNALOFCHINESEUNIVERSITIES研究论文

一种热蛋白质组学分析数据的归一化方法

甄雪妍，周宝津，刘静雯，任艳

（上海中医药大学科技实验中心,上海201203）

摘要建立了一种小分子靶标蛋白的鉴定方法,即引入索引保留时间(Indexedretentiontime,iRT)肽段作为非

标记热蛋白质组学(Thermalproteomeprofiling,TPP)分析定量归一化内标,实现对小分子靶标的准确挖掘.将

iRT肽段加入到表征良好的模型药物甲氨蝶呤(Methotrexate,MTX)处理的293T细胞提取液中,在不同温度加热

处理时它们稳定存在,因此可作为定量归一化的标准.实验结果表明,以iRT作为定量校正,不仅对总蛋白含

量有良好的校正效果,同时对MTX的靶标蛋白