遗传数据管理操作.pdfVIP

2管理和操作遗传数

据

1SimonC.Heath2

KarlW.Broman和

1

生物统计学系，约翰霍普金斯大学，巴尔的摩，马里兰州，

2法国埃夫里塞德克家组型

2.1引言

遗传学家必须学习编程：为了提高效率，避免在数据中引入错误，并使原本

不可能的事情变得简单。如果遗传学家只学种编程语言，Perl将是一

个极佳的选择；它特别适合于文本文件的处理，而这些文本文件是大多数统

计遗传软件的输入和输出。

我们从数据中学习的能力依赖于数据的准确性和完整性。因此，必须以

极大的谨慎来和管理数据。随着遗传数据规模和复杂性的不断增长，对

正式的数据管理方法的需求也在不断增加。

许多数据以矩形形式存在：许多在多个变量上进量。然而，遗

传数据通常具有更复杂的结构，包括系谱信息和遗传图谱。此外，还没有出

现的数据格式，也没有一个全面的统计遗传软件包。遗传数据分析通常

需要使用多个计算机程序每个程序都有其独特的数据输入格式。

，

因此，在统计遗传分析中，一个基本任务是操作数据文件，以符合各种

软件工具所需的多种输入格式。这