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2025面向前沿大型语言模型生物学知识的综合基准测试研究报告（完整版）

前言

近年来，大型语言模型（LargeLanguageModels,LLMs）在自然语言处理、知识问答、内容生成等领域实现跨越式发展，其在专业领域的知识掌握与应用能力成为行业研究热点。生物学作为一门涵盖分子生物学、细胞生物学、遗传学、生态学、生物信息学等多个细分领域的复杂学科，具有知识体系庞大、概念关联性强、专业术语密集、研究成果迭代快速等特点，对LLMs的知识理解、逻辑推理、跨领域整合及专业应用能力提出了极高要求。

2025年，全球范围内涌现出一批前沿大型语言模型，包括通用型模型（如GPT-4o、Claude3.5Sonnet、Gemini3Pro、DeepSeek-V3等）与生物学专用型模型（如BioGPT-2、GeneGPT、scGPT等）。这些模型在预训练阶段融入了大量生物学文献、数据库及研究成果，但不同模型在生物学知识的覆盖广度、理解深度、推理准确性及实际应用能力上存在显著差异。然而，当前针对LLMs生物学知识的基准测试仍存在诸多不足：一是测试任务单一，多集中于简单知识问答，缺乏对复杂推理、实验设计、数据解读等高阶能力的评估；二是测试数据集存在数据污染问题，部分测试样本源于模型预训练语料，导致测试结果失真；三是缺乏跨细分领域的综合评估框架，难以全面衡量模型的生物学综合能力