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探秘miRNA：Drosha识别位点特征剖析与剪切位点精准预测

一、引言

1.1miRNA研究背景

在生命活动的中心法则中，遗传物质DNA转录生成信使RNA，再由信使RNA翻译成蛋白质，从而完成新陈代谢、生长发育等各项生理功能。然而，细胞（尤其是高等生物细胞）内还存在着大量不翻译成蛋白质的RNA，被称为非编码RNA。它们在基因表达调控等关键生命活动过程中发挥重要作用，与细胞分化、个体发育以及疾病发生与发展密切相关。其中一类功能重要的小非编码RNA是microRNA（miRNA），它们长约21~24个碱基，普遍存在于从线虫到人类等高等生物中，而且很多miRNA的生物学功能在进化过程中保守。自1993年首次发现以来，已有数以万计的miRNA被鉴定，其中一些被作为癌症等疾病的诊断标志物和药物研发靶点。因此，miRNA的功能及其自身的生成与调控机制一直都是生物医学研究热点。

具有功能的miRNA是由一条包含一个颈环结构的更长转录本（又称pri-miRNA）经过两步切割反应而产生。第一步切割反应在细胞核内进行，由Drosha/DGCR8复合物催化完成，其中Drosha为III型RNA切割酶，是核心催化组分，DGCR8为双链RNA结合蛋白，负责招募pri-miRNA底物。核内切割产生长度约60-70个碱基