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传染病病原体检测规程

传染病病原体检测规程

一、（1）高通量测序技术的深度整合。在传染病病原体检测规程中，高通量测序技术已成为突破传统检测方法局限的核心手段。不同于常规PCR检测仅能针对已知靶点进行定性分析，新一代测序平台可对临床样本中的全部核酸序列进行无偏倚筛查，尤其适用于新发、突发传染病的病原体鉴定。例如在未知发热疫情处置中，检测人员可通过对患者咽拭子、肺泡灌洗液等样本进行宏基因组测序，72小时内即可完成从核酸提取到病原体溯源的全流程，较传统分离培养法缩短至少5天时间。技术规程中需明确测序数据的生物信息学分析标准，包括低质量序列过滤阈值设定为Q20≥90%，病原体数据库需涵盖NCBIR