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蛋白质复合物识别算法相关研究

目录

TOC\o1-3\h\u16044蛋白质复合物识别算法相关研究 1

231621.1蛋白质复合物 1

19401.2蛋白质复合物识别算法研究 2

151461.2.1CFinder软件介绍 2

313431.2.2ClusterONE算法介绍 3

200891.2.3MCODE算法介绍 4

319951.2.4MCL算法介绍 5

43551.2.5EA算法介绍 6

目前，越来越多的算法被直接应用或在经典聚类算法的基础上改进后被应用，以达到识别蛋白质复合物的目标。尽管其中很多算法经验证在效率、性能等方面具有较好的表现形式，但由于蛋白质网络本身的结构存在多样性、数据处理方式不同等可能导致数据结果出现偏差，此外网络中也存在着不可完全避免的噪声，这些噪声目前还没有办法做到完美过滤。以上所述的这些因素都会影响识别的准确性，因此，科研人员始终致力于研究蛋白质相互作用网络，并将其作为蛋白质复合物识别研究的基础。本章介绍蛋白质复合物的概念，选取经典和近几年提出的蛋白质复合物识别方法进行介绍，通过比较各类方法的优势与不足，为后续实验对比提供思路。

1.1蛋白质复合物

蛋白质复合物是由两个以上功能相关的多肽链通过二硫键或其它相互作用形成的，简单讲，将具有共同生物学功能的蛋白质组结合到一起就形成