基于边缘聚集系数社会网络分析在生物信息学中应用.pdfVIP

社会网络在生物信息学中的应用

1.研究背景

鉴定必需蛋白质是了解细胞生命最低要求的关键，对药物设计也很重要。由

于高通量技术的发展，蛋白质-蛋白质相互作用数据的迅速增加使得在网络上检

测蛋白质重要性成为可能。必需蛋白是指对生物体能力不可或缺的蛋白质，

这些蛋白质中一旦有一种，足以导致生物体或不育，因此，必需的蛋白

质（或）可以被认为是人类病原体的潜在药物靶点。传统的生物实验例如单

敲除、RNA以及条件敲应用在必需蛋白识别中，然而，这些方法通常是

耗时耗力的，对技术方面的要求特别高。考虑到这些实验限制，一种高度精确的

识别必需蛋白质的计算方法将具有很大的价值。近些年来，一些研究者在研究蛋

白质在相互作用网络中的地位方面做出了巨大的努力，提出了一系列的

性措施，并将其用于基于网络拓扑特征的基本蛋白质的发现。然而，这些方法大

多数倾向于只关注单个蛋白质的位置，而忽略了相互作用与蛋白质重要性之间的

相关性。蛋白质-蛋白质相互作用网络最初的思想也于社会网络，为了避免

现有方法的不足，有研究人员提出基于边缘系数鉴定必须蛋白（NC），它既

考虑节点的性，又考虑节点与邻居之间的关系，节点的重要