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基于图注意力的药物神经毒性预测结题报告

一、研究背景与问题提出

药物神经毒性是药物研发过程中面临的关键挑战之一。据统计，约有15%的上市药物因潜在的神经毒性风险被黑框警告，甚至撤市，给患者安全和药企研发投入带来巨大损失。传统的神经毒性评价方法主要依赖动物实验和细胞模型，存在周期长、成本高、物种差异导致的预测准确性不足等问题。例如，在药物研发的临床前阶段，动物实验平均需要耗时2-3年，成本超过千万美元，但仍有超过90%的候选药物因安全性问题在临床试验阶段失败，其中神经毒性是重要原因之一。

随着人工智能技术在药物研发领域的快速发展，基于机器学习的药物毒性预测方法逐渐成为研究热点。早期的机器学习模型多采用传统的特征工程方法，将药物的分子结构、物理化学性质等转化为固定维度的特征向量，再利用支持向量机、随机森林等模型进行预测。然而，这类方法存在明显的局限性：一方面，人工提取特征难以全面捕捉药物分子的复杂结构信息和生物活性位点；另一方面，传统模型无法有效处理药物分子之间的关联关系，而药物在生物体内的作用往往是多分子相互作用的结果。

图神经网络（GraphNeuralNetworks,GNNs）的出现为解决上述问题提供了新的思路。药物分子天然具有图结构，原子可视为节点，化学键可视为边，图神经网络能够直接对这种图结构数据进行建模，自动学习分子的结构特征。其中，图注意力网络（GraphAtt