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人类癌症差异表达miRNA数据库构建与应用.pdf

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dbDEMC:人类中差异表达miRNA的数

据库

1,2,3†、2†、2、4、5、5、姚磊1、6、苗若愚3、7,8、赵

毅2、1,9、3*

来自亚太生物信息学网络(APBioNet)第九届国际生物信息学会议(InCoB2010)

东京。2010年9月26‑28日

小RNA(miRNA)是一类长约22个核苷酸的非编码RNA,能在转录后水平负调

控表达。其在胚胎发育、细胞、分化和凋亡等多种生物学过程中的关键作用已获

广泛认可。研究表明miRNA的异常表达可能与包括在内的多种人类疾病相关。为此

我们建立了人类差异表达miRNA数据库(dbDEMC),用于探索不同中异常表

达的miRNA。

结果:我们从48个经同行评议的微阵列数据集中收集了14种类型的miRNA表达谱,

采用微阵列显著性分析方法筛选出与正常组织相比表达水平显著差异的miRNA。该数据

库各数据集中差异表达mi

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