高质量花生花序全长cDNA文库的构建和鉴定.pdf

豆科基因组学与遗传学(网络版), 2011 年, 第 2 卷, 第 14-19 页 Douke Jiyinzuxue Yu Yichuanxue (online), 2011, Vol.2, 14-19 研究论文 Research Article 高质量花生花序全长 cDNA 文库的构建和鉴定 陈华 , 姜宝杰 , 邓烨 , 曾建斌 , 张冲 , 庄伟建 福建省作物分子与细胞生物学重点实验室, 福建福州, 350002 通讯作者: weijianz1@163.com; 作者 豆科基因组学与遗传学, 2011 年, 第 2 卷, 第 2 篇 doi: 10.5376/.2011.02.0002 收稿日期：2011 年 2 月 20 日 接受日期：2011 年 3 月 01 日 发表日期：2011 年 3 月 14 日 这是一篇采用《Creative Commons Attribution License》进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无 条件的使用与传播。 建议的最佳引用格式： 陈华等, 2011, 高质量花生花序全长 cDNA 文库的构建和鉴定, 豆科基因组学与遗传学 Vol.2 No.2 (doi: 10.5376/.2011.02.0002) 摘 要 为构建花生花序全长cDNA文库，为花生花序功能基因的筛选与克隆，花序发育分子调控网络研究奠定基础。本研 究采用SMART (switching mechanism at 5 end of RNA transcript)技术构建花生花序全长cDNA文库，经涂平板测定文库的克隆 数，PCR测定重组率，酶切反应快速鉴定插入片断的大小，随机测序并进行生物信息学分析检测文库质量。结果表明，原始 6 文库库容为 1.2×10 cfu ，插入片段大小多在 1.0~2.0 kb之间，平均大小在 1.3 kb左右，重组率达 100%。生物信息学分析显 示本文库信息量丰富，并包含了大量未知功能的新基因。所构建文库的代表性和重组片段的序列完整性达到了用于目的基因 的分离筛选和克隆表达的建库要求。 关键词 花生; 花序; 全长 cDNA 文库; SMART 技术 Construction and evaluation of a High-qulity peanut inflorescence full-length cDNA liabray Hua Chen , Baojie Jiang , Ye Deng , Jianbin Zeng , Chong Zhang , Weijian Zhuang Fujian Key Lab of Crop Molecular and Cell Biology, Fuzhou, 350002 Corresponding author, weijianz1@163.com; Authors This paper was first published in Legume Genomics and Genetics, which redistributed in Chinese under the terms of the Creative Commons Attribution License. Abstract Flower is a key organ in peanut which was an active research area in model plants. Construction of a high inflorescence cDNA Library will provides foundations for screening and cloning inflorescence functional genes, which could do benefit to disclosing molecular regulation mechanism underneath inflorescence development in peanut (Arachis hypogaea L.). A cDNA l