利用5.8SrDNAITS序列对两种赤潮亚历山大藻进行分子鉴定.docVIP

【标题】利用5.8SrDNA-ITS序列对两种赤潮亚历山大藻进行分子鉴定 【作者】邹霞 【关键词】赤潮??亚历山大藻? 5.8S rDNA-ITS序列??分子鉴定 【指导老师】梁 姗 【专业】生物科学 【正文】引言 11?国内外利用5.8SrDNA-ITS序列对物种进行分子鉴定发展动态 11.1关于5.8SrDNA-ITS序列 12?关于A.tamarense和A. catenella的分类 22.1?关于A.tamarense和A. catenella的介绍 22.1.1?链状亚历山大藻(A. catenella) 32.1.2?塔玛亚历山大藻( A. tamarense) 42.2 A. tamarense和A. catenella的分类难点 52.3?利用5.8SrDNA-ITS序列进行亚历山大藻属的分子鉴定 53?利用5.8SrDNA-ITS序列对A. tamarense和A. catenella进行分子鉴定 63.1?实验材料 63.2 A. tamarense和 A. catenella5.8SrDNA-ITS序列的分析 63.3?系统发育树的构建和遗传距离值的计算 93.4?验证通过5.8SrDNA-ITS序列能否获得准确可靠的种间分类鉴定 104?利用5.8SrDNA-ITS序列对A. tamarense和 A. catenella?进行分子鉴定技术存在的问题及展望 104.1?该分子鉴定技术存在的问题 104.2?对分子鉴定技术存在的展望 11参考文献 12致??谢 14引言 赤潮（red tide）亦称“红潮”，通常是指一些海洋微藻、原生动物或细菌在水体中过度繁殖或聚集而令海水变色的现象,藻华有时称水华或藻花，习惯上将水体中藻类达到一定密度后的藻华称作赤潮[1]。赤潮对海洋生态系统、海洋渔业、水产资源和人类造成严重的破坏，主要包括赤潮对海洋生态平衡的破坏、对海洋渔业和水产资源的破坏、对人类健康的危害[2-3]。其中亚历山大藻属?(Alexandrium)是一类重要的海洋赤潮甲藻，广泛分布于北美、欧洲、亚洲等海域中[4]，其中一半左右能够产生麻痹性神经贝毒。有些赤潮生物分泌赤潮毒素，当鱼、贝类处于有毒赤潮区域内，摄食这些有毒生物，虽不能被毒死，但生物毒素可在体内积累，其含量大大超过食用时人体可接受的水平。这些鱼虾、贝类如果不慎被人食用，就引起人体中毒，严重时可导致死亡[5-6]。?近年有毒亚历山大藻引发的赤潮造成的海水养殖业损失和人体中毒事件在国内外均有发生。然而亚历山大藻多为单细胞藻，形态学特征受环境变化及不同生理阶段的影响较大，鉴定通常需要通过特殊的染色和甲壳解剖，使用电子显微镜鉴定，对于形态上特别相似的物种往往是难以定论[7-8]。近十几年来分类学家开始采用分子生物学方法研究甲藻的分子进化[9]。已应用的技术包括限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP)、随机扩增多态性 DNA(Random Amplified Polymorphic DNA, RAPD)、荧光免疫分析(Fluorescence Immunoassay Analysis, FLA)、酶免疫分析(Enzyme Immunoassay Analysis, EIA)等。由于rDNA序列已被广泛应用于生物系统发育和分类学研究，而且它含有许多保守性不同的区域，可以应用于不同的分类学水平，因此，有关亚历山大藻种系进化的研究主要基于对rDNA序列的分析，其中应用最广泛的是利用核糖体5.8S rDNA和转录间隔区(internal transcribed spacers, ITS)序列进行分类[10]。为了减轻赤潮带来的危害和避免造成巨大的损失，基于分子生物学的方法对藻种快速而准确的鉴定，对于赤潮的预报和防治具有重要的现实意义。1?国内外利用5.8SrDNA-ITS序列对物种进行分子鉴定发展动态1.1关于5.8SrDNA-ITS序列80年以来,随着分子生物学的迅猛发展及实验技术的突破，人们可以在基因组水平上对生物进行指纹分析，形成了分子分类技术。随着对生命本质探索的深入以及新的分子生物学方法和技术的突破,分子数据大量积累并与日俱增，使人们完全能够从分子水平认识生物物种分化的内在原因和物质基础以及各类生物的分子进化历史,从而引起了微藻分类研究领域中的变革。分子分类包括同工酶分析、蛋白质分析为基础的分类方法。同工酶和蛋白质分析技术通过属、种间不同酶系统的同工酶或某些蛋白质的基因型和酶谱带差异比较,进行物种的划分。由于这些方法具有酶带明确、简单、较少主观性的优点，已广泛应用于植物近缘种、属或品种的分类