基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究策略简介.pdfVIP

微生物学通报 NOV 20, 2011, 38(11): 1705−1714 Microbiology China © 2011 by Institute of Microbiology, CAS tongbao@ 专论与综述 基于第二代测序技术的细菌基因组与 转录组研究策略简介 1,2∆ 1,2∆ 1,2 1,2 1* 1* 刘万飞 王西亮 赵宇慧 曾瀞瑶 耿佳宁 胡松年 (1. 中国科学院北京基因组研究所基因组科学及信息重点实验室 北京 100029) (2. 中国科学院研究生院 北京 100049) 摘 要: 随着基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究越来越广泛, 选择合适的研究策略 变得越来越重要。就基于第二代测序技术的细菌基因组和转录组研究策略进行综述, 并简要介绍 细菌基因组和转录组研究中的机遇和挑战。综述细菌基因组与转录组研究的常规方法及步骤, 并简要地介绍存在的问题。细菌基因组和转录组研究策略为大多数细菌的研究提供了一个相对 完整的研究路线, 同时也会促进其它领域的研究, 如生命形成、生物进化、基础代谢、疾病、药 物等。 关键词: 细菌, 基因组, 转录组, 第二代测序技术 The brief introduction of research strategies for bacterial genome and transcriptome based on the next-generation sequencing technologies LIU Wan-Fei1,2∆ WANG Xi-Liang1,2∆ ZHAO Yu-Hui1,2 ZENG Jing-Yao1,2 GENG Jia-Ning1* HU Song-Nian1* (1. Key Laboratory of Genome Science and Information , Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100029, China) (2. Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) Abstract: Recently, many bacterial genome and transcriptome studies have been performed based on the next-generation sequencing technologies. Therefore, how to select the appropriate research strate- gies is becoming increasingly important. In this paper, we discussed the research strategies of ba