蛋白质模体序列的统计分析及其识别.pdfVIP

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2017-09-18 发布于安徽
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蛋白质模体序列的统计分析及其识别.pdf

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35 5 () http: / /www. kustjourna.l com / V ol 35 N o5 20 10 10 Journal ofK unm ing U n iversity of Sc ience and T echnology ( Sc ience and T echnology) Oct 2010 do:i 10 3969 / j issn 1007- 855x 2010 05 019 姜雪 ( , 111003) : 通过对相似性小于 33% 的 1 423 个蛋白质的模体序列的统计分析, 选取了适合的序列固定模式长. 用阵打分的方法, 以氨基酸出现的频数为参数, 识别了模体. 并用自恰和独立检验两种方法对算法进行了检验, 均获得了较好的识别效果. : 模体; 统计分析; 打分函数; 蛋白质结构 : Q 61 : A : 1007 - 855X ( 2010) 05 - 0083- 06 Recognition and StatisticalAnalysis of motif in Protein J IA NG Xue ( B asic D epa rtm en t on L iaoyang Cam pu s, Shenyang U n iv ers ity o f T echno logy, L iaoyang, L iaon ing 111003, China) A stract: Through the analysis o f m otif sequ ences of 1423 pro te in ch ain s wh ich sh are sequ ence ident ity less th an 33% , applicable fixed length pattern s are obta ined W ith the adoption of the scoring m atrix, a m ot if is predicted w ith am ino ac id as a param eter It is then verified by se lf- con sistency and indep enden t data set test The resu lts o f pred iction are proven to be fa irly good Key words: m ot if; statistica l ana lysis; scoring function; prote in stru cture 0 20 90 , , 1995 Gurunath[ 1] , - , - - , - - - , - ; 1996 Sun[ 2] 240 [ 3 ] , 11; 2006 [ 4] , loop - , - , - - 1997 Sun [ 5] (ANN ), ; 2002 C ruz [ 6]