甘蔗细胞色素C基因的电子克隆与分析.docVIP

  甘蔗细胞色素 C 基因的电子克隆与分析# 张玉叶，黄宁，肖新换，苏炜华，黄珑，罗俊，阙友雄** （福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中 5 10 15 20 25 30 35 40 心，福州 350002） 摘要：以甘蔗类似细胞色素 C 的 EST 序列 CF576943.1 为探针，通过电子克隆技术获得了 甘蔗细胞色素 C 基因(cytochrome C，Cyt C)的一条 cDNA 全长序列，命名为 ScCyt C。用生 物信息学方法对该基因氨基酸序列与组成、亚细胞定位、跨膜区与信号肽、疏水性/亲水性、 蛋白质二、三级结构以及功能等进行分析与预测。结果表明：Cyt C 基因全长 1073 bp，编 码 112 个氨基酸，该基因位于细胞质，为非分泌型蛋白，无规卷曲为主要二级结构原件，含 有 1 个保守功能域，主要功能为翻译并且在不同植物中具有高度保守性。电子表达分析结果 显示，该基因在甘蔗各个组织均有表达，其中在茎和根中的表达量比其他组织类型中表达量 高，此外，该基因的表达可能受到低温的调控。本研究为甘蔗细胞色素 C 基因的实验克隆、 结构分析与功能鉴定提供了进一步参考。 关键词：甘蔗；Cyt C 基因；电子克隆；生物信息学；电子表达分析 中图分类号：请查阅《中国图书馆分类法》 Electronic cloning and c