海洋沉积物中现存微生物化学标志物完整极性膜脂研究进展.pdfVIP

第２５卷　第５期 地球科学进展 Ｖｏｌ．２５　Ｎｏ．５ ２０１０年５月 ＡＤＶＡＮＣＥＳＩＮＥＡＲＴＨＳＣＩＥＮＣＥ Ｍａｙ，２０１０ 文章编号：１００１８１６６（２０１０）０５０４７４１０ 海洋沉积物中现存微生物化学标志物 完整极性膜脂研究进展 １，２，３ １，２ 姚　鹏 ，于志刚 （１．海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室，山东　青岛　２６６１００； ２．中国海洋大学化学化工学院，海洋有机地球化学研究所，山东　青岛　２６６１００； ３．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＣｈｅｍｉｓｔｒｙ，ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＹｏｒｋ，ＹｏｒｋＹＯ１０５ＤＤ，ＵＫ） 摘　要：完整极性膜脂作为活的微生物细胞的化学标志物，能够反映海洋沉积物中现存微生物群落 结构和生物量等信息。与生物学方法相比，完整极性膜脂分析技术具有无需培养、快速和普适性等 特点。综述了海洋沉积物中细菌和古菌的细胞膜完整极性膜脂的组成特点及其在生物地球化学和 微生物生态学等研究中的应用，重点评述了在生物地球化学循环中有特殊作用的微生物，如厌氧氨 氧化细菌、甲烷氧化古菌、氨氧化古菌、具有四醚膜脂结构的海洋泉古菌等，或者是一些特殊生态系 统，如冷泉、海底深部生物圈等研究中完整极性膜脂应用的进展。还简要介绍了完整极性膜脂的分 析方法，并对其应用前景进行了展望。 关　键　词：现存微生物；细菌；古菌；完整极性膜脂；化学标志物 中图分类号：Ｐ５９３　　　文献标志码：Ａ 变化影响的理解；并能促进我们对海洋沉积物中微 １　引　言 ［２］ 生物资源和矿产资源的开发 。 海洋沉积物中存在着大量的微生物，其中许多 对海洋沉积物中微生物多样性的研究，生物学 是未知的种类，它们的栖息地从沉积物—水界面开 上的手段主要分成２类，一类是基于微生物富集和 ［１］ 始，可能延深到海底以下几千米深处 。由于栖息 培养的传统研究方法，另一类是基于核酸提取和聚 环境的特殊性，与陆地微生物比较，海洋沉积物中的 合酶链反应（ＰｏｌｙｍｅｒａｓｅＣｈａｉｎＲｅａｃｔｉｏｎ，ＰＣＲ）的非 ［６］ 微生物可能具有某些不同的代谢途径和遗传背 培养分子生物学技术手段 。由于微生物原位（ｉｎ ［２］ 景 ，同时研究表明这些微生物在有机碳的分解和 ｓｉｔｕ）生长率一般较慢，且经常出现多种类群共生现 ［３］ ［４］ 再矿化 、甲烷的厌氧氧化 、氮的循环（包括硝化 象，使得可培养的微生物数量非常有限（０．００１％～ ［５］ ［７］ 反硝化、厌氧氨氧化等） 等海洋生物地球化学循 ０．１％） 。近年来，基于ＰＣＲ反应和核糖体小亚基 环过程中发挥了重要作用。对这些微生物的研究将 单位 ｒＲＮＡ（１６ＳｒＲＮＡ）分析的非培养分子生物技 有助于了解它们生存、进化和对环境的适应机制，对 术的进步和发展，很好地克服了富集培养方法所存 ［２］ 于生命的起源、进化的基础研究具有重要价值 ； 在的缺点，使得环境样品中基因序列的直接分析