H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶基因特性研究.pdfVIP

应用预防医学2011年12月第17卷第6期 321 论著 中图分类号：R373．1+3 文献标识码：A 文章编号：1673—785X(2011)06—0321—07 H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶基因特性研究 刘海燕，范云燕，林新勤，秦剑秋，黄莉，覃巍巍 广西南宁市疾病预防控制中心(530011) [摘要] 目的 了解H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶(NA)基因变异规律方法采用狗肾传代细胞法对流感病 毒进行分离培养，提取病毒RNA，逆转录一聚合酶链式反应，扩增NA基因后进行核苷酸序列测定。测序结果与WHO 全球流感疫苗株序列进行氨基酸序列同源比对，并采用MEGA 4．0构建系统进化树，计算遗传距离。结果NA氨基 酸序列的系统进化树表明，南宁市2007年H3N2亚型人流感病毒株被分为4个分枝，其中大部分病毒株位于分枝I 和分枝Ⅱ中。氨基酸序列比对表明，NA没有发生氨基酸的缺失与插入，总体上比较保守，NA的酶活性中心、二硫 键和糖基化位点基本保持不变。NA不同抗原决定簇变异频率不同，L370S变异出现在多数病毒株中。非结构功能位 点也发生了不同程度的变异情况，其中K249E变异是导致分枝Ⅱ出现的主要因素。结论NA基因的这些特性为流 感的防控以及NA抑制剂药物的应用提供了一定的参考依据。 【关键词】 人流感病毒；H3N2亚型；神经氨酸酶；序列变异 ofthe characteristicoftheneuraminidaseofhumaninfluenzavirus H3N2 Analysisgenetic subtype LIU centersfordiseasecontroland Hai—yah，FANYun．．yan，LIN Xln-qhl，eta1．Guangxinanningcity prevention (530023) Tounderstandthelawof andvariationofthe human [Abstract】Objective heredity influenzavirus H3N2．MethodsInfluenzaisolatedwere MDCK subtype viruses culturedin cells．ViralRNAswere and extracted RT-PCR．The were and amplified byusing amplifiedproductspurifiedsequenced．Multiplealignment Clustalwas ontheNA withthatofH3N2vaccinestrains using performed proteinsequencestogether WHO．Geneticdistanceand treeofthesestrainswereobtained MEGA4．0．ResultsThe by phylogenetic byusing eousensus treeconstructed methodshowedthatthestrainsweredividedinto phylogenetic usingNeighbor—