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APPLICATION e-Science 应用
协同与分布式数据库技术在高通量组
学研究中的应用
崔球 徐健
中国科学院青岛生物能源与过程研究所,青岛 266101
摘 要:本文通过已开展或正在开展的应用实例来着重说明协同与分布式数据库技术
在组学研究领域中的重点应用,具体阐述了在远程跨地域实验室信息管理、
组学数据的协同注释和分布式计算分析、分布式数据整合和挖掘等方面的应
用,向读者展示了信息化技术可以为生物学研究提供的各种便利和必不可少
的分析工具。
关键词: 系统生物学;代谢组学;分布式数据库;协同注释
The Application of Concurrent and Distributed
Database Technique to High-Throughput
“Omics” Research
Cui Qiu,Xu Jian
Qingdao Institute of BioEnergy and Bioprocess Technology,Chinese Academy of
Sciences,Qingdao China,266101
Abstract: This paper presents the application of concurrent and distributed database technique
to “omics” research by case studies. To demonstrate the essential power that
informatics techniques brought in, we specifically focused on the systems designed
for: remote lab informatics management, concurrent annotation of “omics” data and
distribution of computational tasks, information integration and data mining from
distributed, semantically heterogeneous data sources.
Keywords: System biology;Metabolomics;Distributed database;Concurrent annotation
e-Science 总第6期 37
e-Science 应用 e-Science 技 术
APPLICATION
1.引言 息化系统上,包括仪器预约、样 品可能需要依次在不同实验室流
品准备、数据采集存储、数据分 通,分别进行不同的分析实验。
现代生物技术研究正处于一 析等一系列过程。如果这个信息 因此能够提供远程跨地域协同工
个大规模变革的时期。组学学科 系统出现了问题,整个中心的运 作环境的实验室信息管理平台是
的技术进步,例如基因组测序技 作都会瘫痪。然而,目前我国信 非常重要的,这个平台首先需要
术的进
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