SSR标记技术在水稻遗传育种中的应用.pdfVIP

维普资讯 2007年簟3期 盈 羞舀 综 SSR标记技术在水稻遗传育种中的应用 吕桂兰 ，丁 芬 ，沈 枫 ，马秀芳 ，唐志强 (辽宁省农业科学院 稻作研究所 ，沈阳 110101) 摘 要：SSR是建立在 PCR基础上的分子标记，与RFLP、RAPD、AFLP相 比，SSR具有多态性高、结果稳定可靠、重复性好、 操作简单等特点 ，已在水稻研究中被广泛应用。阐述了SSR标记的基本原理与操作规程，介绍了其在构建水稻连锁图谱、 水稻品种特异性鉴定及水稻分子标记辅助育种等方面的应用情况 。并分析了 目前SSR在应用中所存在 的问题 ，提 出相应 的解决方法，以期推动SSR标记技术在遗传育种研究中的进展，从而加速育种进程。 关键词：SSR；分子标记；水稻遗传育种 中图分类号：S511．O32 文献标识码 ：A 文章编号：1673-6737(2007)03一o023一O4 ApplicationofSSR MarkerTechniqueto Geneticand Breeding in Rice LV Gui-lan ，DING Fen 。SHEN Feng 。MA Xiu-fang ，TANG Zhi-qiang (LiaoningRiceResearchImfi~e，LiaoningAcademyofAgriculturalSciences，Shenyang110101，China) Abstract：Comparedwith RFLP,RAPD andAFLP，SSR isatypeofmalkerbasedonPCR，havingmorepolymorphisms， stableand relina tresdm，good replication，nad easyhnadling，and has been applied widely in riceresearch．In this paper,hte fundamentalprinciple nad protocol，construction oflinked map，specified identfiication ofrice variety，and marker-assisted selection are introducedandhteproblemsexisting in hteapplication ofSSR nad itscountermeasuresare demonstratde toaccelerate 印plication ofSSR toricebreedingprogrma ． Keywords：SSR；Molecularmarker,Geneticandbreedinginrice 分子标记 的应用始于20世纪80年代 ，目前 随机分布在染色体上，目前初步估计在水稻基因 已经发展了多种类型的标记方法。有 以southern 组 中大约有 70o0~100oo个微卫星。Research 杂交技术为核心的分子标记和以PCR技术为核 Genetics公司在INTERNET网上公布 了水稻中的 心的分子标记。在人及动植物中，包括内含子、外 商用卫星标记。 显子及染色体上的任一区域，均存在 1-6个碱基 SSR分子标记数量几乎是无限的，没有生长 对组成的简单重复序列，又称之为微卫星DNA。 发育阶段和组织特异性，在苗期甚至种子阶段即 SSR分子标记最早开始于 1996年All等人对人 可对植株的基因型加以鉴定。SSR标记没有上位 类基因组的研究。之后，在拟南芥、玉米、水稻、小 性效应，不受环境条件和其它因素的影响，表现为 麦等多种植物中被广泛应用。Panaud等对水稻基 中性标记 ；与形态标记相 比具有极显著的优越性 ， 因组中各类微卫星的分布进行研究。研究结果表