高分辨三重四极杆质谱定量测定复杂基体中目标肽新方法.pdfVIP

高分辨三重四极杆质谱定量测定复杂基体中目标肽新方法.pdf

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Application 高分辨三重四极杆质谱定量测定复杂基体中目标肽的新方法 Note: 412_C Reiko Kiyonami, Scott Peterman, Rosa Viner, Amol Prakash, and Vlad Zabrouskov Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA 前言 从而提高了检测信号的质量。大多数商品 目前一般生物标志物实验的终点是发现公认 化仪器采用单位分辨(0.7 FWHM)进行 的标志性蛋白名单,接下来的一步就应该是 母离子选择。Thermo Scientific生产的TSQ 在扩展患者群体内完成对这些靶向蛋白的定 Quantum Ultra质谱仪是唯一可以进行高分 量测定,以评价它们作为标志物的有效性。 辨(0.2 FWHM)母离子选择的三重四极杆 对这些在复杂基体中的靶向蛋白进行可靠的 质谱仪,可以采用高选择性反应监测模式 关 键 词 定量分析,其分析准确度和精密度是必需 (H-SRM)。这就极大的降低了背景化合 • TSQ Quantum Ultra™ 的。对低丰度蛋白质进行高通量检测,对于 物的干扰,并保证了高传输效率7。此外, • H-SRM workflow 宽动态范围、高灵敏度和稳健易用性都有 该仪器可以监测LC运行中超过每秒300组 • QED-MS/MS 严格的要求。基于串连质谱的选择反应监测 H-SRM离子对,并采用定量增强数据关联 • Targeted 4 Quantitative (SRM)流程,对于复杂生物基体中所研 扫描(QED-MS/MS)来进行肽序列鉴定 。这 Proteomics 究蛋白的特异肽可以进行高灵敏度和高选择 些独特的优点使得TSQ Quantum Ultra质谱 性的定量,同时也可以独立进行生物标志物 仪成为定量分析蛋白质组的理想仪器。 验证1-4。该方法的主要优点是具有很低的检 测限,即,该方法可以在具有高化合物背景 本文验证了TSQ Quantum Ultra质谱仪在用 的复杂基体中检测低浓度水平肽,同时保证 于人血清酶解液中待测肽的定量分析时, 良好的定量准确度和精密度。 显示出高选择性和高灵敏度的优势。研究 建立了通过高分辨率的母离子分离和目标 由于大多数标志性蛋白没有标准品可用,所 肽多碎片离子时间序列检测,同时进行目 以,为进行蛋白定量有必要对SRM实验中 标肽的鉴定和定量的测定方法。将该方法 所出现的峰进行鉴定。传统实验中,经常应 与传统的SRM模式MS/MS肽定量检测方法 用SRM模式MS/MS 全扫描,通过数据库搜 进行了对比,其中,TSQ Quantum Ultra质 5

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