基于16S rDNA序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究.pdfVIP

第 31卷第 11期 水 产 科 学 Vo1．31NO．11 2012年 11月 FISHERIES SCIENCE NOv．2O12 基于 16SrDNA序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究 程汉 良，周曼纯，陈冬勤，彭永兴，董志国，易乐飞，孟学平，申 欣 (淮海工学院 江苏省海洋生物技术重点实验室，江苏 连云港 222005) 摘 要：对 21种帘蛤科贝类线粒体 16SrRNA基因片段的核苷酸序列进行了分析，以探讨这一序列在 种质鉴定、分子系统发育研究中的应用价值。试验结果表明，所有物种扩增片段长度 504 642bp，具 有明显的长度多态性，序列A+T含量 59．2 ～69．0 ，明显高于GC含量。物种间共有变异位点447 个，其中简约信息位点 351个。以16SrDNA片段序列为标记，以中国蛤蜊做外群，构建了帘蛤科贝类 的系统发生树，拓扑结构显示，帘蛤科贝类形成 3个明显类群，缀锦蛤亚科的 13个种形成一个单系群， 其结点 自展值为 93 。第二类群 由雪蛤亚科、帘蛤亚科和镜蛤亚科的种类组成，结点 自展值为 87 。 第三类群由仙女蛤亚科、青蛤亚科、楔形蛤亚科和文蛤亚科的种类组成，结点 自展值为 100％。结合拓 扑结构分析和序列比对分析，本研究支持将短文蛤和丽文蛤订为文蛤的同物异名的观点，建议将丽文 蛤和短文蛤订为文蛤的地理亚种；支持将薄片镜蛤和Dosiniaangulosa订为 2个独立种的观点；宜将波 纹 巴非蛤和织锦 巴非蛤订为 2个独立种。 关键词：帘蛤科；线粒体DNA 16SrDNA；系统发育 中图分类号：$917．4 文献标识码iA 文章编号：1003—1111(2012)1i-0657—06 帘蛤科贝类在传统分类上隶属软件动物门、双 生物学数据 。该研究可以为帘蛤科 的种质资源保 壳纲、帘蛤 目，为双壳贝类 中最大的一个科，约有 护提供指导，为种质鉴定提供遗传学基础数据。 500多种，很多种类具有重要的商业价值[1]。 《中国 1 材料与方法 动物志——软件动物 门 双壳纲 帘蛤科》记载了中 国沿海的 12个亚科，28属，17个亚属共 88种帘蛤 1．1 样品收集 科贝类 ]。由于帘蛤科种类多，形态变异大，不同 试验材料包括 中国沿海帘蛤科 7个亚科 13个 学者对其分类系统的安排及演化等 问题持有不同 属的21种贝类，每物种至少采样 3O个个体。所有 观点[1]，并难 以取得一致意见。近几年分子生物 标本均保存于 95 酒精 中，样品的分类地位、采集 学技术的发展为探讨帘蛤科贝类分类和演化等 问 地 、凭证标本号和 GenBank登录号等信息见表 1。 题提供 了一条新的途径 。国内外基于 16SrDNA、 并从 GenBank中下载 了 13种帘蛤科 贝类 的 16S COI等序列的帘蛤科分子系统发育 已进行 了一些 rDNA相关序列用于聚类分析(表 1)。 研究[1。]。此外，还对帘蛤亚科[7]、文蛤属[8]、缀 1．2 DNA提取 锦蛤亚科[1。。n等的系统发育进行了研究，解决了一 每物种取 3个个体用于DNA提取，取后闭壳 些 问题 。但对 中国沿海帘蛤科的系统发育还缺乏 肌约 50mg，提取总 DNA并溶于TE中，一20℃保 全面 、系统研究。 存备用 。 帘蛤科贝类在我国海洋经济中占有重要地位 。 1．3 PCR扩增及其产物克隆测序 目前 ，已开展养殖的有文蛤 (Meretrixmeretrix)、 目的片段扩增参照 Anderson[1]设计兼并引 青蛤(Cyclinasinensis