白斑综合征病毒江苏分离株变异区和缺失区基因的序列比较.pdfVIP

中国水产科学 2011年9月，18(5)：1196—1201 JouraalofFisherySciencesofChina 研 究简报 DoI：lO．3724／SP．J．1118．2011．01196 白斑综合征病毒江苏分离株变异区和缺失区基因的序列比较 薛晖，王晓丰，丁正峰，唐建清 江苏省淡水水产研究所，江苏 南京 210017 摘要：为了解白斑综合征病毒(Whitespotsyndromevirus，wssv)在养殖克氏原螯虾(Procambarusctarkii)中的感染 流行情况和分子流行病学特征，以及探讨不同病毒株间的遗传进化差异，2008年 7月至2010年 6月在江苏各主要 克氏原螯虾养殖产区共采集了83份样品，应用环介导等温扩增技术(LAMP)检测 42份样品为病毒感染阳性，阳性 率达50．6％。在此基础上考虑地理和时间因素选取了兴化 、盱眙等地的6份样品，PCR扩增 、克隆了样品中所携带 病毒的变异区和缺失区基因并对其进行了测序 。分析结果显示，在变异区除兴化毒株为 1829bp之外，其余各分离 株间差异微小，均在 1440bp左右；而在缺失区各毒株大小均为 384bp，且核苷酸序列完全一致。随后将各分离株 序列与GenBank已公布的毒株做进一步的序列比较分