《生物信息学》第六章基因芯片分析.pptVIP

第六章 基因表达数据分析 生物信息学和基因芯片是新内容; 提纲 一 基因芯片简介 (1)基因芯片的发展历史 (2)基因芯片的分类 (3)基因芯片的基本原理 (4)基因芯片的技术流程 (5)基因芯片的应用 二 生物信息学在基因芯片中的应用 (1)基因芯片数据流关系图 (2)生物信息学在基因芯片中的应用 一 基因芯片简介 2. 基因芯片的分类 3. 基因芯片的基本原理 基因芯片（gene chip），又称DNA微阵列（microarray），将大量探针以高密度固定于支持物上，然后与标记的核酸样品进行杂交，通过检测杂交信号的强弱进而判断样品中靶分子的数量。 基因芯片的基本原理: 碱基互补匹配。 4. 基因芯片的技术流程 5. 基因芯片的应用 基因芯片用于基因诊断: 通过基因芯片诊断地中海贫血患者的血液细胞发现在B-珠蛋白基因中存在3个明确的突变位点. 二、生物信息学在基因芯片中的应用 体现在三个方面: 芯片设计 可靠性分析 数据分析 (1) 芯片设计的一般性原则 (1)互补性 (2)敏感性和特异性 (3)容错性: 采用冗余探针 (4)可靠性 (5)可控性: 设置质量控制探针 (6)可读性: 通过探针布局,使杂交信号便于观察理解 一个理想的基因芯片图像具有以下几个性质： （1）芯片单元的形状和尺寸相同； （2）