沙冬青GATA型锌指蛋白基因序列及表达分析.pdfVIP

第 33卷 第 3期 北 京 林 业 大 学 学 报 Vo1．33．NO．3 2O11年 5月 JOURNAL OFBEIJING FORESTRY UNIVERSITY May．2011 沙冬青 GATA型锌指蛋 白基 因序列及表达分析 史军娜 刘美芹 师 静 王艳萍 智冠华 陈玉珍 卢存福 (北京林业大学林木育种国家 工程实验室 ，教育部林 木花卉遗传育种重点实验室) 摘要 ：根据沙冬青低温干旱诱导 cDNA文库表达序列标签中锌指蛋 白基 因序列设计特异引物 ，采用 PCR技术扩增 锌指蛋白基因AmZFPG的 cDNA全长。序列分析表明，cDNA全 长669bp，推测编码 223个氨基酸残基 、分子量约 25kD的蛋 白质。氨基酸保守性分析及 同类锌指结构 比对表 明AmZFPG属于 GATA结合蛋 白家族 ，且具有高度的 保守性 。系统发生分析表 明，其与紫花苜蓿富含脯氨酸 的细胞壁蛋 白进化亲缘关系最近 。半定量 RT—PCR分析显 示 ，AmZFPG基因是受低温和干旱诱导表达上调 的基 因，初步得 出AmZFPG基 因与沙冬青低温和干旱胁迫 响应 相关 。 关键词 ：沙冬青 ；锌指蛋 白；序列分析 ；表达分析 中图分类号 ：$759．95 文献标 志码 ：A 文章编号 ：1000—1522(2011)03—0021—05 SHIJun—na；LIU Mei—qin；SHIJing；W ANG Yan—ping；ZHIGuan—hua；CHEN Yu—zhen；LU Cun—fu． Sequenceanalysisand expression pattern ofAmZFPG encoding aGATA typezincfingerprotein inAmmopiptanthusmongoficus．JournalofBeijingForestryUniversity(2011)33(3)21—25 [ch，17 ref．]NationalEngineeringLaboratoryforTreeBreeding，KeyLaboratoryofGeneticsandBreedingin ForestTreesandOrnamentalPlantsofMinistryofEducation，BeijingForestryUniversity，100083，P．R． China． W e designed specialprimers according to the zinc finger protein gene sequence in expressed sequencetagsfrom a cold--and drought—treatedAmmopiptanthusmongolicuscDNA library andamplified cDNA ofAmZFPG byPCR．The cDNA ofAmZFPG iscomprisedof669basepairswhich encodea zinc fingerproteinwith273aminoacidsandamolecularweightof25kD．Bioinformaticanalysisindicatesthat AmZFPG belongsto GATA—binding protein family and shareshigherhomology with given zinc finger proteinswhichareinvolved in stressresistanceinotherplantspecies．Phylogeneticanalysisindicatesthat AmZFPG ismostcloselyrelated toMedicagosativa proline—rich cellwallprotein．SemiquantitatiVeRT— PCR analysisshowsthattheexpression ofAmZFPG isconstitutive and up—regul