日本血吸虫精氨酸酶编码基因eDNA的分离和序列分析.pdfVIP

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维普资讯 中山医科大学学报(AcadJSUMS),2001.22(2):85~88 · 基础研究 · 日本血吸虫精氨酸酶编码基因eDNA的分离和序列分析 吴忠道,郑亦男,徐 劲,余新炳 (中山医科大学寄生虫学教研室,广东 广州 510089) 摘 要:【目的】分离和鉴定 日本血吸虫(Schisto~maia加 icm,s7)新基因。方【法】应用免疫学方法筛选 s7eDNA 文库获得阳性克隆;通过PCR直接序列测定技术 ,表达序列标签(EST)同源性检索对阳性克隆插入片段进行鉴定:采用亚克 隆技术及生物信息学等技术,对获得的日本血吸虫精氨酸酶编码基因序列进行结构与功能的分析。 【结果】获得了一个含 l061bp外谅插入片段的阳性克隆,其 eDNA序列舍有一十840bp的阅读框,编码 279个氨基酸,属精氨酸酶家族,与国际蛋 白质库中的酵母、蛙、人和大鼠精氨酸酶序列的同源性分别为44%,5O%,51%,53%和54%。 【结论l获得了编码 日本血吸虫 精氨酸酶编码基 因全长 cDNA,为 日本血吸虫精氨酸酶基因功能的研究奠定丁基础。 关键词 :日本血吸虫;精氨酸酶:序列分析 ,eDNA 中图分类号:R3832 文献标识码:A 文章编号:1000—257X(2001)02—0085—04 IsolationandSequenceAnalysisofthecDNA Encoding Schistosomajaponicum Arginase WU Zhong-dao,ZHENGYi—ni~12,XU Jing.YIJXin—bing (Deparrme/ttofParasitoLogy,SunYat—senUniversityofMedicalSelenc~,Guangzhou510089,China) Absttact:O【bjectives】ToisolateandidentifynovelgenesofSchistosomajaponicum(SJ)fromeDNAli— brary 【Methods】eDNAcloneswerescreenedfromSJcDNAlibrarybyimmunologicalmethod,theinsertsof positiveeDNA cloneswereidentifiedbyPCRdircetde esquencingandhomologoussearchingofEST,theeDNA sequenceencodingSJarginasewasanalyzedbythesubcloningandbioinformatics.【Results】Thepositive eDNA clonewith1061bpinsertwasioslatedfrom S.icDNA library,whiehsequenceoftheinesrtincludde a OREwith840bp,andtranslatde into279aminoacidresidues.ThededucedpmteinWaSsimilartOtheraginaSe fma ily,thehomologyatma inoacid sequencelevelwas44%,50% ,51% ,53% and54% withschizosacch— arora . ycespombe(fissionyeast)raginaes,xenopuslaevis(africna clawedfrog)raginase,homosapiens(human) arginaesiiprecurosrandrattu$noruegicus(rat)arginaseiiprecursorrespectively.【Conclusion】Thefull—length cDNAsequenceencodingSchistosomajaponicumarginasewasclonde,whichgavethebasisforfurtherstudying ofSchistoso

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