细菌紫红质中氢键相互作用和质子转移机理的分子模拟.pdfVIP

维普资讯 2008年第 66卷 化 学 学 报 V0l1．66．2oo8 第4期．433~436 ACTA CHIM ICA SINICA No．4．433～436 · 研究论文 · 细菌紫红质中氢键相互作用和质子转移机理的分子模拟 卢 涛 李象远米 (四川大学化工学院 四川大学纳米生物医学技术与膜生物学研究所 成都 610065) 摘要 用CHARMM程序以细菌紫红质 1R84晶体为模型，模拟了在等温定容条件下细菌紫红质在 lps过程中的变化， 分析了与质子传递相关的ASP85，ASP212和水分子与视黄醛间氢键的结构变化情况．考虑到氨基酸残基和席夫碱质子 的不同距离，考察了E